为什么我的 PCA 不起作用？ [复制]答案

【问题标题】：Why doesn't my PCA work? [duplicate]为什么我的 PCA 不起作用？ [复制]
【发布时间】：2015-03-13 00:00:22
【问题描述】：

我有一个包含 200 行和 20 列的数据集，我想在 R 中使用 prcomp() 执行 PCA。但这不起作用，因为当我执行 str(x) 时，我的第一列被列为整数。第一列的数字介于 0 和 4 之间，表示用于获取我的数据集的加热类型。所以这也必须在 PCA 中使用，因为我知道加热类型对其他 19 列有影响，但我无法启动 PCA，因为它被列为整数。我该如何解决这个问题？

该列包含重要信息，我也想使用此信息，但我不能，因为它被列为整数而不是数字，当我尝试 as.numeric() 时，它显示"Error: (list) object cannot be coerced to type 'double'"。

我用

解决了

dat_test$heating<-as.numeric(as.character(dat_test$heating))
str(dat_test)

但是我的 PCR 还是不行。

data.prcomp<-prcomp(dat_test,scale.=TRUE,na.rm=TRUE)

Error in svd(x, nu = 0) : infinite or missing values in 'x'

我总共有 2 个 NA 值。这应该仍然适用于na.rm 或na.action=na.omit，但它没有。

【问题讨论】：

你看过这个讨论吗？ stackoverflow.com/questions/12078291/…我认为通过对您问题的第一部分的编辑，这可能是重复的。
@LJW 抱歉...我找到了您在上面引用的帖子，除了我自己的搜索之外没有任何其他内容。我很高兴看到它得到了证实。干杯。

标签： r pca

【解决方案1】：

好吧，我知道你在调查什么。一些分层建模似乎很普遍。所以 prcomp 没有 na.rm 参数。该函数为此使用 na.action。

因此，在研究了这个特定的解决方案之后——稍等片刻——站在 Giants 的肩膀上，我发现了这个。我认为它可以为你工作。我还建议您更深入地研究您正在尝试的方法。搜索会发现比你所知道的更多。干杯。

prcomp(na.omit(dat_test), scale = TRUE)

【讨论】：