在 Linux 中比较文本文件中两列的特定部分答案

【问题标题】：Compare specific parts of two columns in a text file in Linux在 Linux 中比较文本文件中两列的特定部分
【发布时间】：2019-11-25 07:36:54
【问题描述】：

我有一个文本文件，其中有几列由制表符分隔，如下所示：


    1    ATGCCCAGA  AS:i:10   XS:i:10  
    2    ATGCTTGA   AS:i:10   XS:i:5  
    3    ATGGGGGA   AS:i:10   XS:i:1  
    4    ATCCCCGA   AS:i:20   XS:i:20

我现在想比较最后两列 AS:i:(n1) 和 XS:i:(n2) 以仅获取 n1 与 n2 不同的行。所以，我想要的输出是：

    2    ATGCTTGA   AS:i:10   XS:i:5  
    3    ATGGGGGA   AS:i:10   XS:i:1

您能否建议我一些比较 n1 和 n2 并打印输出的方法？提前致谢。

【问题讨论】：

您想要的输出似乎是这两个值不同而不相同的行...
不管怎样，这都是一条微不足道的 awk 行。你试过什么？

标签： linux text multiple-columns

【解决方案1】：

正如 Shawn 所说，您可以在 awk... 或 perl ... 或 sed 中执行此操作。

一个 AWK 示例可能是

awk '{split($3,a,":");split($4,b,":");if(a[3]!=b[3]) print $0}' infile.txt

如果您熟悉 awk，这应该是不言自明的

【讨论】：

如果我记得早点回来看看 OP 是否澄清了这个问题，我会建议 awk -v FS="[\t:]" '$5 != $8' infile.txt