如何在 R 中导入 .rec 文件答案

【问题标题】：how to import .rec files in R如何在 R 中导入 .rec 文件
【发布时间】：2018-08-31 17:49:54
【问题描述】：

我有一个要导入 R 的 .rec 文件。我已将 .rec 文件保存到我的工作目录中。这是我尝试过的。

library(foreign)  
library(RODBC)  
data.test <- read.epiinfo("data_in.rec")

我得到这个错误：

Error in if (headerlength <= 0L) 
stop("file has zero or fewer variables: probably not an EpiInfo file") : 
  missing value where TRUE/FALSE needed

另外：警告信息：

1：

In readLines(file, 1L, ok = TRUE) :
  line 1 appears to contain an embedded nul

2：

In strsplit(line, " ") : input string 1 is invalid in this locale

我在网上查看了 R 中的 read.epiinfo 帮助包。帮助包说

某些更高版本的 Epi Info 使用 Microsoft Access 文件格式来存储数据。这可以通过 RODBC 包读取。

我有两个问题。
1. 我得到的错误是因为我拥有的 .rec 文件来自高于 6 的 Epi Info 版本吗？
2.如何使用RODBC库打开.rec文件？

【问题讨论】：

我不知道.rec 文件是什么，但该错误强烈表明该文件无法识别（可能已损坏或为空）。如果您手动查看文件（notepad++、less、...），它看起来对吗？ file.info("CF031_22FEB2016.rec")$size 你觉得合适吗？（我不知道。）顺便说一句：变量怎么可能少于零？这是一个令人困惑的错误......
感谢您的编辑。 .rec 文件是多导睡眠图 (EEG) 数据的时间序列记录。 file.info("CF031_22FEB2016.rec")$size 给我的文件大小为 1004614016。
这个多导睡眠图 (EEG) 数据是从 Epi Info 导出的吗？
说实话@Stedy 我不确定。这是临床医生给我的。我有 google .rec 文件，它告诉我它们是 Epi Info 文件。
好的，那么我会尝试来自@r2evans 的评论 - 尝试在文本编辑器（记事本、记事本++、less 等）中打开并查看文件。您甚至可以使用read.table() 将其读入 R

标签： r rodbc european-data-format

【解决方案1】：

.rec（或 .REC）文件原来是 .EDF（欧洲数据格式）文件类型。使用库 edfReader 在 R 中轻松打开它。 edfReader 库帮助文件对于打开文件和提取时间序列数据非常有用。请参阅下面的代码了解我使用的内容。代码改编自帮助文件。

install.packages('edfReader')
library(edfReader)
?edfReader  
lib.dir <- system.file("data_in.rec",package="edfReader")  
Cfile <- paste(lib.dir,'/edfPlusC.edf',sep='')  
CHdr <- readEdfHeader("data_in.rec")  
CSignals <- readEdfSignals(CHdr)  
summary(CSignals)

【讨论】：