【问题标题】:NiftyNet 'evaluation' action output is incorrectNiftyNet“评估”操作输出不正确
【发布时间】:2018-04-09 09:39:41
【问题描述】:

我尝试在推理后使用新的“评估”操作为我的输出生成一些指标。但是,对于我的每个数据量,.csv 文件仅显示平均距离的分数为“0”,而 Jaccard 和 Dice 的分数为“1”。我似乎找不到任何有关评估操作的文档,所以我不确定我做错了什么。此外,--dataset_to_infer=Validation 选项似乎不起作用,推理和评估都应用于所有数据,而不仅仅是验证集。

谢谢!

【问题讨论】:

    标签: niftynet


    【解决方案1】:

    对于评估问题,我们正在编写文档。 dataset_to_infer 选项仅针对NiftyNet/niftynet/application 中的应用程序进行测试;模型动物园中的应用程序尚未升级以支持它(如果您认为这是一个错误,请提交一个包含更多详细信息的问题https://github.com/NifTK/NiftyNet/issues)。

    【讨论】:

      【解决方案2】:

      目前,直接指向 config.ini 中的推理结果对我有用。

      例如
      [inferred] csv_file = model_dir/save_seg_dir/inferred.csv

      我相信当前找不到此文件,然后评估默认为将标签与标签进行比较。请参阅 GitHub 上的 issue

      【讨论】:

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