通过 os.system 调用奇异 exec 命令后执行 os.system python 命令答案

【问题标题】：executing os.system python commands after invoking a singularity exec command via os.system通过 os.system 调用奇异 exec 命令后执行 os.system python 命令
【发布时间】：2021-09-20 17:03:55
【问题描述】：

所以我有一个 python 程序，它通过 os.system 在 .sif 文件上调用奇异 exec。然后在我程序的下一行，我再次使用 os.system 来尝试运行 python 脚本。我以为这会启动奇点，然后从中运行我的脚本，但是目前它只运行 exec 命令，将我带入容器，然后挂起（它不执行 python 命令）。

有人对此问题有任何建议或经验吗？

谢谢。

【问题讨论】：

一个好问题包括minimal reproducible example——其他人可以运行以查看问题或修改以测试其修复的最短代码。
也就是说——一般而言，根本不应该使用os.system()。 subprocess 模块提供了更多的控制，并抛弃了一些融入os.system() 设计的错误决策（就像C 中system() 函数的设计一样，这同样糟糕）。负责任的 C 程序员不再使用system()。负责任的 Python 程序员也不应该使用os.system()。

标签： python os.system singularity-container

【解决方案1】：

Singularity exec 运行单个指定命令，它不会将执行环境更改为奇异图像的执行环境。

如果您需要交互式会话，请使用：singularity shell my_image.sif

如果您需要运行多个命令，请编写一个 shell 脚本并使用它：singularity exec my_image.sif my_script.sh

或者，使用奇异性来运行您的 python 脚本。然后一切都将在映像而不是主机的上下文中完成。

【讨论】：