【发布时间】:2013-06-03 15:04:04
【问题描述】:
我正在尝试在 Python 3.0 中编写代码以逐行重新格式化数据文件。代码读取每一行,将该行转换为列表,然后读取列表的每个元素。然后修改每个列表元素并将其复制到输出文件中。
问题在于某些元素包含反斜杠字符,Python 会将其解释为命令或莫名其妙地忽略。 Python中有什么方法可以读取和/或提取列表的元素作为原始字符串或文字字符串?
我的代码如下:
import shlex
import sys
import fileinput
import string
inputFile = list(open("inputfile.txt","r"))
outputFile = open("outputFile.txt","a")
for i in range(1,len(inputFile)):
print(inputFile[i])
line = shlex.shlex(inputFile[i], posix = True)
line.whitespace = "\t"
line.whitespace_split = True
line = list(line)
for j in range(0,3):
cell = line[j]
cell_1 = cell.replace("\\","\\\\")
outputFile .write(("%s\t")%(cell_1))
for k in range(4,len(line)):
cell = str(line[k])
cell_1 = cell.replace(" | ","\t")
if cell_1 == "-":
outputFile .write("-\t-\t")
if cell_1 == "unknown":
outputFile .write("unknown\t-\t")
else:
outputFile .write(("%s\t")%(cell_1))
输入的一个例子是: GA10034 7421353 7424287 FBgn0070093 Dpse\GA10034 蛋白水解 |从InterPro 的电子注释推断:IPR007484 - - - - 未知 - - - 肽酶活性|从带有 InterPro:IPR007484 的电子注释推断 - - - - - -
一个示例输出行是: GA10034 7421353 7424287 DpseGA10034 蛋白水解从使用 InterPro:IPR007484 的电子注释推断 - - - - - - - - - - - - 未知 - - - - - - - - - - 从使用 InterPro:IPR007484 的电子注释推断的肽酶活性 - - - - - - - - - -
在输出中删除了 Dpse 和 GA10034 之间的 \。
(该脚本还在输出中的每个新行的开头添加一个制表符 - 从第二行开始 - 并且莫名其妙地在输入文件的 3/4 处失败,声称有“没有结束引号”;但我认为最好一次解决一个问题)
【问题讨论】:
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您能添加一个带有输入和所需输出的示例吗?
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那么...您的实际问题是什么?预期输出是多少,与实际输出相比如何?如果您真正向我们展示您遇到的问题,您会得到更多关注。老实说,在我看来,您可能只是想多了。
标签: python string list python-3.x