如何从 cox.zph R 函数中提取属性

Question

我需要在R中cox.zph函数的输出中提取特定行的p属性。

为了让您有疑问，我将我的问题描述如下，并通过一个示例逐步说明：

require('survival')

# I create the simplest test data set

test1 <- list(time=c(4,3,1,1,2,2,3), 
          status=c(1,1,1,0,1,1,0), 
          x=c(0,2,1,1,1,0,0), 
          sex=c(0,0,0,0,1,1,1))

# Fit a stratified model 

coxmodel <- coxph(Surv(time, status) ~ x + strata(sex), test1)

然后，我使用cox.zph函数：

zph <- cox.zph(coxmodel)

输出如下：

    rho chisq    p
x 0.354 0.322 0.57

我试图通过使用attributes(zph) 来获取p 属性值（在本例中为0.57），但p 没有出现以执行zph$p 之类的操作。我还使用了plyr 包，但没有结果。

有人可以帮助我吗？谢谢。

Answer 1

这里是：

zph$table[ , "p" ]

您可以使用 $ 访问 zph 对象的成员，因为它是一个列表：

names( zph )
# returns:
# [1] "table"     "x"         "y"         "var"       "call"      "transform"

然后查找zph$table 并转至。

在 R 中，通常可以通过$（S3 OO 框架）或@（S4 OO 框架）访问对象的不同“槽”。