在 Ubuntu AMI 上为 R 安装 XGBoost GPU答案

【问题标题】：Installing XGBoost GPU for R on Ubuntu AMI在 Ubuntu AMI 上为 R 安装 XGBoost GPU
【发布时间】：2018-01-15 01:59:42
【问题描述】：

我在 AWS deeplearning Ubuntu AMI 上尝试使用此处的说明安装 XGboost GPU 版本 R 包：http://xgboost.readthedocs.io/en/latest/build.html#building-with-gpu-support

我已经克隆了 repo，创建了一个新的构建目录，然后执行：

cmake .. -DUSE_CUDA=ON -DR_LIB=ON

错误：

/usr/lib/R/bin/exec/R: symbol lookup error: /usr/lib/libblas.so.3: undefined symbol: gotoblas
/usr/lib/R/bin/exec/R: symbol lookup error: /usr/lib/libblas.so.3: undefined symbol: gotoblas
/usr/lib/R/bin/exec/R: symbol lookup error: /usr/lib/libblas.so.3: undefined symbol: gotoblas
CMake Error at /usr/share/cmake-3.5/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:148 (message):
  Could NOT find LibR (missing: LIBR_HOME LIBR_INCLUDE_DIRS LIBR_LIB_DIR)
Call Stack (most recent call first):
  /usr/share/cmake-3.5/Modules/FindPackageHandleStandardArgs.cmake:388 (_FPHSA_FAILURE_MESSAGE)
  cmake/modules/FindLibR.cmake:173 (find_package_handle_standard_args)
  CMakeLists.txt:165 (find_package)

我相信这是由于 libblas.so.3 文件位于 /home/ubuntu/src/OpenBLAS 而不是更标准的位置。只需要一点点推动来弥补我缺乏 linux 环境变量知识并将两者联系起来。谢谢！

【问题讨论】：

您能确认您的 R 安装工作正常吗？此外，通过运行.libPaths() 查看包含您的 R 包的目录。

标签： r ubuntu installation gpu xgboost

【解决方案1】：

您可以尝试创建从预期位置到共享库文件的实际位置或包含预期共享库文件的目录的符号链接来解决问题。

【讨论】：