在本地安装 Numpy答案

【问题标题】：Installing Numpy locally在本地安装 Numpy
【发布时间】：2012-06-05 00:34:45
【问题描述】：

我在远程计算机上拥有一个没有 root 权限的帐户，我需要安装 Python 的本地版本（远程计算机的 Python 版本与我的某些代码不兼容），那里有 Numpy 和 Scipy。从昨天开始，我一直在尝试在本地安装 numpy，但没有成功。

我在 /home/myusername/.local/ 中成功安装了本地版本的 Python (2.7.3)，因此我通过执行 /home/myusername/.local/bin/python 访问此版本的 Python。我尝试了两种安装 Numpy 的方法：

我从官网上下载了最新的稳定版Numpy，解压，进入解压后的文件夹，结果：/home/myusername/.local/bin/python setup.py install --prefix=/home/myusername/.local。但是，我收到以下错误，然后是一系列其他错误（源自此错误）：
```
gcc -pthread -shared build/temp.linux-x86_64-2.7/numpy/core/blasdot/_dotblas.o
-L/usr/local/lib -Lbuild/temp.linux-x86_64-2.7 -lptf77blas -lptcblas -latlas 
-o build/lib.linux-x86_64-2.7/numpy/core/_dotblas.so
/usr/bin/ld: /usr/local/lib/libptcblas.a(cblas_dptgemm.o): relocation 
R_X86_64_32 against `a local symbol' can not be used when making a shared 
object; recompile with -fPIC
```
不知道这意味着什么（除了错误显然与 LAPACK 库有关），我只是执行了与上面相同的命令，但现在按照错误的建议输入 LDFLAGS='-fPIC'，即我做了 LDFLAGS="-fPIC" /home/myusername/.local/bin/python setup.py install --prefix=/home/myusername/.local。但是，我得到了同样的错误（除了在上面的 gcc 命令之后添加了前缀 -fPIC）。
我尝试使用 pip 安装它，即在我的本地路径中成功安装 pip 后执行/home/myusername/.local/bin/pip install numpy /）。但是，我得到了完全相同的错误。

我在网上搜索过，但似乎没有一个错误与我的相似。我的第一个猜测是，这与一些需要 root 权限才能执行的代码有关，或者可能与 LAPACK 库的版本有关。

帮忙，有人吗？

【问题讨论】：

【解决方案1】：

错误消息告诉您，您的 ATLAS 库尚未使用 -fPIC 标志构建。这意味着它不能链接到像 Python 扩展模块这样的共享库。您需要使用 -fPIC 标志重建 ATLAS。 ATLAS 文档描述了如何执行此操作。

【讨论】：

【解决方案2】：

从源代码构建有点痛苦。是否可以避免这样做？

如果我们假设您尝试在 x86 计算机（Intel、AMD 等）上安装，您是否可以将 Python 安装在另一台您确实具有 root 权限的 x86 计算机上，然后制作一个 tar Python安装的存档，将tar复制到另一台计算机，然后解压tar存档？

上面的问题是，预构建的 Python 可能有硬编码的路径来查找库：它可能需要库位于 /usr/share 或其他位置。这将是一个 hack，但你可以创建一个 chroot jail 并让 Python 运行。

您可能还想看看 Enthought Python Distribution (EPD)。我相信 EPD 安装程序只会询问您希望 EPD 安装在哪里，然后将其安装在那里。

有一个免费版本的环保署。如果您想要 64 位，则必须为 EPD 付费，但如果 32 位适合您，那么您可能只需要 EPD Free。

附： Enthought 网站似乎拒绝任何不以www. 开头的 URL！这意味着某些 Google 搜索链接不起作用，除非您编辑它们以在开头插入 www.。我相信他们很快就会解决这个问题。

【讨论】：

是的，事实上，我认为这就是问题所在：代码试图使用来自 /usr/bin/ld 的库。但是，我真的需要本地安装；只是复制一个已经编译的对我来说似乎不安全。
我认为你可以相信 Enthought 不会将特洛伊木马攻击或其他不好的东西放入他们的 Python 构建中。但是，如果您真的更喜欢构建它，我希望它对您有用。嗯。也许您应该尝试在具有 root 权限的机器上从软件构建，然后将构建的 tar 存档并传输它？至少这可以让您控制用于构建的 Fortran 编译器以及诸如此类的事情。

【解决方案3】：

您可能希望查看 EasyBuild 以构建启用了 numpy 和 scipy 的本地 Python 版本，请参阅 http://hpcugent.github.com/easybuild/。

它基本上把所有讨厌的东西都带走了，你只需要稍微配置一下（例如，指定你希望软件在哪里结束），然后你就可以用你选择的包构建 Python一个命令。

【讨论】：