【发布时间】:2015-12-09 16:34:49
【问题描述】:
我正在使用 caret 包在 R 中训练模型:
ctrl <- trainControl(method = "repeatedcv", repeats = 3, summaryFunction = twoClassSummary)
logitBoostFit <- train(LoanStatus~., credit, method = "LogitBoost", family=binomial, preProcess=c("center", "scale", "pca"),
trControl = ctrl)
我收到以下警告:
Warning message:
In train.default(x, y, weights = w, ...): The metric "Accuracy" was not in the result set. ROC will be used instead.Warning message:
In nominalTrainWorkflow(x = x, y = y, wts = weights, info = trainInfo, : There were missing values in resampled performance measures.
Something is wrong; all the ROC metric values are missing:
ROC Sens Spec
Min. : NA Min. :0.03496 Min. :0.9747
1st Qu.: NA 1st Qu.:0.03919 1st Qu.:0.9758
Median : NA Median :0.04343 Median :0.9770
Mean :NaN Mean :0.04349 Mean :0.9779
3rd Qu.: NA 3rd Qu.:0.04776 3rd Qu.:0.9795
Max. : NA Max. :0.05210 Max. :0.9821
NA's :3
Error in train.default(x, y, weights = w, ...): Stopping
我安装了 pROC 包:
install.packages("pROC", repos="http://cran.rstudio.com/")
library(pROC)
Type 'citation("pROC")' for a citation.
Attaching package: ‘pROC’
The following objects are masked from ‘package:stats’:
cov, smooth, var
这是数据:
str(credit)
'data.frame': 8580 obs. of 45 variables:
$ ListingCategory : int 1 7 3 1 1 7 1 1 1 1 ...
$ IncomeRange : int 3 4 6 4 4 3 3 4 3 3 ...
$ StatedMonthlyIncome : num 2583 4326 10500 4167 5667 ...
$ IncomeVerifiable : logi TRUE TRUE TRUE FALSE TRUE TRUE ...
$ DTIwProsperLoan : num 1.8e-01 2.0e-01 1.7e-01 1.0e+06 1.8e-01 4.4e-01 2.2e-01 2.0e-01 2.0e-01 3.1e-01 ...
$ EmploymentStatusDescription: Factor w/ 7 levels "Employed","Full-time",..: 1 4 1 7 1 1 1 1 1 1 ...
$ Occupation : Factor w/ 65 levels "","Accountant/CPA",..: 37 37 20 14 43 58 48 37 37 37 ...
$ MonthsEmployed : int 4 44 159 67 26 16 209 147 24 9 ...
$ BorrowerState : Factor w/ 48 levels "AK","AL","AR",..: 22 32 5 5 14 28 4 10 10 34 ...
$ BorrowerCity : Factor w/ 3089 levels "AARONSBURG","ABERDEEN",..: 1737 3059 2488 654 482 719 895 1699 2747 1903 ...
$ BorrowerMetropolitanArea : Factor w/ 1 level "(Not Implemented)": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
$ LenderIndicator : int 0 0 0 1 0 0 0 0 1 0 ...
$ GroupIndicator : logi FALSE FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE ...
$ GroupName : Factor w/ 83 levels "","00 Used Car Loans",..: 1 1 1 47 1 1 1 1 1 1 ...
$ ChannelCode : int 90000 90000 90000 80000 40000 40000 90000 90000 80000 90000 ...
$ AmountParticipation : int 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ MonthlyDebt : int 247 785 1631 817 644 1524 427 817 654 749 ...
$ CurrentDelinquencies : int 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 ...
$ DelinquenciesLast7Years : int 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ PublicRecordsLast10Years : int 0 1 0 0 0 0 1 0 1 0 ...
$ PublicRecordsLast12Months : int 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ FirstRecordedCreditLine : Factor w/ 4719 levels "1/1/00 0:00",..: 3032 2673 1197 2541 4698 4345 3150 925 4452 2358 ...
$ CreditLinesLast7Years : int 53 30 36 26 7 22 15 20 34 32 ...
$ InquiriesLast6Months : int 2 8 5 0 0 0 0 3 0 0 ...
$ AmountDelinquent : int 0 0 0 0 0 0 0 63 0 15 ...
$ CurrentCreditLines : int 10 10 18 10 4 11 6 10 7 8 ...
$ OpenCreditLines : int 9 10 15 8 3 8 5 7 7 8 ...
$ BankcardUtilization : num 0.26 0.69 0.94 0.69 0.81 0.38 0.55 0.24 0.03 0 ...
$ TotalOpenRevolvingAccounts : int 9 7 12 10 3 5 4 5 4 6 ...
$ InstallmentBalance : int 48648 14827 0 0 0 30916 0 21619 41340 15447 ...
$ RealEstateBalance : int 0 0 577745 0 0 0 191296 0 0 126039 ...
$ RevolvingBalance : int 5265 9967 94966 50511 37871 22463 19550 2436 1223 3236 ...
$ RealEstatePayment : int 0 0 4159 0 0 0 1303 0 0 1279 ...
$ RevolvingAvailablePercent : int 78 52 36 45 18 61 44 74 96 76 ...
$ TotalInquiries : int 8 11 15 2 0 0 1 7 1 1 ...
$ TotalTradeItems : int 53 30 36 26 7 22 15 20 34 32 ...
$ SatisfactoryAccounts : int 52 23 36 26 7 19 15 18 34 29 ...
$ NowDelinquentDerog : int 0 0 0 0 0 0 0 1 0 1 ...
$ WasDelinquentDerog : int 1 7 0 0 0 3 0 1 0 2 ...
$ OldestTradeOpenDate : int 5092001 5011977 12011984 4272000 9081993 9122000 6161987 11181999 9191990 4132000 ...
$ DelinquenciesOver30Days : int 0 6 0 0 0 13 0 2 0 2 ...
$ DelinquenciesOver60Days : int 0 4 0 0 0 0 0 0 0 1 ...
$ DelinquenciesOver90Days : int 0 10 0 0 0 0 0 0 0 0 ...
$ IsHomeowner : logi FALSE FALSE TRUE FALSE FALSE FALSE ...
$ LoanStatus : Factor w/ 2 levels "0","1": 2 1 1 2 2 2 2 2 2 1 .`..
总结(学分)
上市类别收入范围规定每月收入收入可核实
分钟。 : 0.000 分钟。 :1.000 分钟。 : 0 模式 :逻辑
第一组:1.000 第一组:3.000 第一组:3167 错误:784
中位数:2.000 中位数:4.000 中位数:4750 真:7796
平均值:4.997 平均值:4.089 平均值:5755 NA:0
第三区:7.000 第三区:5.000 第三区:7083
最大限度。 :20.000 最大。 :7.000 最大。 :250000
DTIwProsperLoan EmployedStatusDescription MonthsEmployed
分钟。 : 0.0 就业人数 :7182 分钟。 :-23.00
第一季:0.1 全日制:416 第一季:26.00
中位数:0.2 未就业:122 中位数:68.00
平均值:91609.4 其他:475 平均值:97.44
第三季:0.3 兼职:7 第三季:139.00
最大限度。 :1000000.0 退休: 32 Max. :755.00
个体经营者:346 名:5
BorrowerState LenderIndicator GroupIndicator ChannelCode
加利福尼亚州:1056 分钟。 :0.00000 模式:逻辑最小值。 :40000
FL : 608 1st Qu.:0.00000 FALSE:8325 1st Qu.:80000
纽约:574 中位数:0.00000 正确:255 中位数:80000
TX : 532 平均值 :0.09196 NA :0 平均值 :77196
IL : 443 第三区:0.00000 第三区:90000
GA:最大 343 :1.00000 最大。 :90000
(其他):5024
每月债务本期拖欠拖欠最近 7 年
分钟。 : 0.0 分钟。 : 0.0000 分钟。 : 0.000
第一区:364.0 第一区:0.0000 第一区:0.000
中位数:708.0 中位数:0.0000 中位数:0.000
平均值:885.5 平均值:0.4119 平均值:4.009
第三区:1205.2 第三区:0.0000 第三区:3.000
最大限度。 :30213.0 最大。 :21.0000 最大。 :99.000
Public RecordsLast10Years PublicRecordsLast12Months CreditLinesLast7Years
分钟。 : 0.0000 分钟。 :0.00000 分钟。 : 2.0
第一区:0.0000 第一区:0.00000 第一区:16.0
中位数:0.0000 中位数:0.00000 中位数:24.0
平均值:0.2809 平均值:0.01364 平均值:26.1
第三曲:0.0000 第三曲:0.00000 第三曲:34.0
最大限度。 :11.0000 最大。 :4.00000 最大。 :115.0
查询最近 6 个月的金额拖欠 CurrentCreditLines OpenCreditLines
分钟。 : 0.0000 分钟。 : 0 分钟。 : 0.000 分钟。 : 0.000
第一区:0.0000 第一区:0 第一区:5.000 第一区:5.000
中位数:1.0000 中位数:0 中位数:9.000 中位数:8.000
平均值:0.9994 平均值:1195 平均值:9.345 平均值:8.306
第三组:1.0000 第三组:0 第三组:12.000 第三组:11.000
最大限度。 :15.0000 最大。 :179158 最大。 :54.000 最大。 :42.000
BankcardUtilization TotalOpenRevolvingAccounts 分期余额
分钟。 :0.0000 分钟。 : 0.000 分钟。 : 0
第一区:0.2500 第一区:3.000 第一区:3338
中位数:0.5400 中位数:6.000 中位数:14453
平均值:0.5182 平均值:6.441 平均值:24900
第三区:0.7900 第三区:9.000 第三区:32238
最大限度。 :2.2300 最大。 :44.000 最大。 :739371
北美:328
RealEstateBalance RevolvingBalance RealEstatePayment RevolvingAvailablePercent
分钟。 : 0 分钟。 : 0 分钟。 : 0.0 分钟。 : 0.00
第一区:0 第一区:2799 第一区:0.0 第一区:29.00
中位数:26154 中位数:8784 中位数:346.5 中位数:52.00
平均值:109306 平均值:19555 平均值:830.5 平均值:51.46
第三区:176542 第三区:21110 第三区:1382.2 第三区:75.00
最大限度。 :1938421 最大。 :695648 最大。 :13651.0 最大。 :100.00
TotalInquiries TotalTradeItems SatisfactoryAccounts NowDelinquentDerog
分钟。 : 0.00 分钟。 : 2.0 分钟。 : 1.00 分钟。 : 0.0000
第一区:2.00 第一区:16.0 第一区:14.00 第一区:0.0000
中位数:3.00 中位数:24.0 中位数:21.00 中位数:0.0000
平均值:3.91 平均值:26.1 平均值:23.34 平均值:0.4119
第三曲:5.00 第三曲:34.0 第三曲:30.25 第三曲:0.0000
最大限度。 :36.00 最大。 :115.0 最大。 :113.00 最大。 :21.0000
WasDelinquentDerog OldestTradeOpenDate DelinquenciesOver30Days
分钟。 : 0.000 分钟。 : 1011957 分钟。 : 0.000
第一区:0.000 第一区:4101996 第一区:0.000
中位数:1.000 中位数:7191993 中位数:1.000
平均值:2.343 平均值:6934230 平均值:4.332
第三区:3.000 第三区:10011990 第三区:5.000
最大限度。 :32.000 最大。 :12312004 最大。 :99.000
DelinquenciesOver60Days DelinquenciesOver90Days IsHomeowner LoanStatus
分钟。 : 0.000 分钟。 :0.000 模式:逻辑 0:1518
第一组:0.000 第一组:0.000 FALSE:4264 1:7062
中位数:0.000 中位数:0.000 真:4316
平均值:1.908 平均值:4.009 NA:0
第三区:2.000 第三区:3.000
最大限度。 :73.000 最大。 :99.000
我没有找到任何缺失值:
try(na.fail(credit))
dput(head(credit,4))
structure(list(ListingCategory = c(1L, 7L, 3L, 1L), IncomeRange = c(3L,
4L, 6L, 4L), StatedMonthlyIncome = c(2583.3333, 4326, 10500,
4166.6667), IncomeVerifiable = c(TRUE, TRUE, TRUE, FALSE), DTIwProsperLoan = c(0.18,
0.2, 0.17, 1e+06), EmploymentStatusDescription = structure(c(1L,
4L, 1L, 7L), .Label = c("Employed", "Full-time", "Not employed",
"Other", "Part-time", "Retired", "Self-employed"), class = "factor"),
MonthsEmployed = c(4L, 44L, 159L, 67L), BorrowerState = structure(c(22L,
32L, 5L, 5L), .Label = c("AK", "AL", "AR", "AZ", "CA", "CO",
"CT", "DC", "DE", "FL", "GA", "HI", "ID", "IL", "IN", "KS",
"KY", "LA", "MA", "MD", "MI", "MN", "MO", "MS", "MT", "NC",
"NE", "NH", "NJ", "NM", "NV", "NY", "OH", "OK", "OR", "PA",
"RI", "SC", "SD", "TN", "TX", "UT", "VA", "VT", "WA", "WI",
"WV", "WY"), class = "factor"), LenderIndicator = c(0L, 0L,
0L, 1L), GroupIndicator = c(FALSE, FALSE, FALSE, TRUE), ChannelCode = c(90000L,
90000L, 90000L, 80000L), MonthlyDebt = c(247L, 785L, 1631L,
817L), CurrentDelinquencies = c(0L, 0L, 0L, 0L), DelinquenciesLast7Years = c(0L,
10L, 0L, 0L), PublicRecordsLast10Years = c(0L, 1L, 0L, 0L
), PublicRecordsLast12Months = c(0L, 0L, 0L, 0L), CreditLinesLast7Years = c(53L,
30L, 36L, 26L), InquiriesLast6Months = c(2L, 8L, 5L, 0L),
AmountDelinquent = c(0L, 0L, 0L, 0L), CurrentCreditLines = c(10L,
10L, 18L, 10L), OpenCreditLines = c(9L, 10L, 15L, 8L), BankcardUtilization = c(0.26,
0.69, 0.94, 0.69), TotalOpenRevolvingAccounts = c(9L, 7L,
12L, 10L), InstallmentBalance = c(48648L, 14827L, 0L, 0L),
RealEstateBalance = c(0L, 0L, 577745L, 0L), RevolvingBalance = c(5265L,
9967L, 94966L, 50511L), RealEstatePayment = c(0L, 0L, 4159L,
0L), RevolvingAvailablePercent = c(78L, 52L, 36L, 45L), TotalInquiries = c(8L,
11L, 15L, 2L), TotalTradeItems = c(53L, 30L, 36L, 26L), SatisfactoryAccounts = c(52L,
23L, 36L, 26L), NowDelinquentDerog = c(0L, 0L, 0L, 0L), WasDelinquentDerog = c(1L,
7L, 0L, 0L), OldestTradeOpenDate = c(5092001L, 5011977L,
12011984L, 4272000L), DelinquenciesOver30Days = c(0L, 6L,
0L, 0L), DelinquenciesOver60Days = c(0L, 4L, 0L, 0L), DelinquenciesOver90Days = c(0L,
10L, 0L, 0L), IsHomeowner = c(FALSE, FALSE, TRUE, FALSE),
LoanStatus = structure(c(2L, 1L, 1L, 2L), .Label = c("0",
"1"), class = "factor")), .Names = c("ListingCategory", "IncomeRange",
"StatedMonthlyIncome", "IncomeVerifiable", "DTIwProsperLoan",
"EmploymentStatusDescription", "MonthsEmployed", "BorrowerState",
"LenderIndicator", "GroupIndicator", "ChannelCode", "MonthlyDebt",
"CurrentDelinquencies", "DelinquenciesLast7Years", "PublicRecordsLast10Years",
"PublicRecordsLast12Months", "CreditLinesLast7Years", "InquiriesLast6Months",
"AmountDelinquent", "CurrentCreditLines", "OpenCreditLines",
"BankcardUtilization", "TotalOpenRevolvingAccounts", "InstallmentBalance",
"RealEstateBalance", "RevolvingBalance", "RealEstatePayment",
"RevolvingAvailablePercent", "TotalInquiries", "TotalTradeItems",
"SatisfactoryAccounts", "NowDelinquentDerog", "WasDelinquentDerog",
"OldestTradeOpenDate", "DelinquenciesOver30Days", "DelinquenciesOver60Days",
"DelinquenciesOver90Days", "IsHomeowner", "LoanStatus"), row.names = c(NA,
4L), class = "data.frame")
有什么想法吗?
Warning message:
In train.default(x, y, weights = w, ...): The metric "Accuracy" was not in the result set. ROC will be used instead.
# weights: 72 (71 variable)
initial value 5144.538374
iter 10 value 3540.667624
iter 20 value 3329.692768
iter 30 value 3279.191024
iter 40 value 3264.926986
iter 50 value 3259.276647
iter 60 value 3259.056261
final value 3259.032668
converged
# weights: 72 (71 variable)
initial value 5144.538374
iter 10 value 3540.774666
iter 20 value 3330.016829
iter 30 value 3279.545595
iter 40 value 3265.384385
iter 50 value 3259.499032
iter 60 value 3259.353010
final value 3259.342601
converged
# weights: 72 (71 variable)
initial value 5144.538374
iter 10 value 3540.667731
iter 20 value 3329.693092
iter 30 value 3279.191379
iter 40 value 3264.927427
iter 50 value 3259.276899
iter 60 value 3259.056561
final value 3259.032978
converged
# weights: 72 (71 variable)
initial value 5144.538374
iter 10 value 3528.401458
iter 20 value 3314.932958
iter 30 value 3264.117072
iter 40 value 3253.780051
iter 50 value 3253.368959
iter 60 value 3253.359047
final value 3253.358819
converged
# weights: 72 (71 variable)
initial value 5144.538374
iter 10 value 3528.508505
iter 20 value 3315.134599
iter 30 value 3265.021404
iter 40 value 3255.739021
iter 50 value 3253.817833
iter 60 value 3253.697180
final value 3253.671003
converged
# weights: 72 (71 variable)
initial value 5144.538374
iter 10 value 3528.401565
iter 20 value 3314.933160
iter 30 value 3264.117768
iter 40 value 3253.780539
iter 50 value 3253.369030
iter 60 value 3253.359358
final value 3253.359133
converged
# weights: 71 (70 variable)
initial value 5145.231521
iter 10 value 4680.326236
iter 20 value 4672.506024
iter 30 value 3662.998233
iter 40 value 3310.207744
iter 50 value 3252.983656
iter 60 value 3250.400275
iter 70 value 3250.339216
final value 3250.332646
converged
... # 权重:72(71 个变量)
初始值 5144.538374
迭代 10 值 4661.569290
迭代 20 值 4652.246624
迭代 30 值 3715.472355
迭代 40 值 3484.096833
迭代 50 值 3254.247424
迭代 60 值 3248.931841
迭代 70 值 3248.154679
迭代 80 值 3248.129089
迭代 80 值 3248.129085
最终值 3248.128574
收敛的
# 权重:72(71 个变量)
初始值 5144.538374
迭代 10 值 4663.660886
迭代 20 值 4654.255466
迭代 30 值 3542.473235
迭代 40 值 3315.027437
迭代 50 值 3250.340679
迭代 60 值 3248.693378
迭代 70 值 3248.455840
迭代 80 值 3248.443345
迭代 80 值 3248.443325
迭代 80 值 3248.443325
最终值 3248.443325
收敛的
# 权重:72(71 个变量)
初始值 5144.538374
迭代 10 值 4661.571382
迭代 20 值 4652.248711
迭代 30 值 4397.069608
迭代 40 值 3532.067046
迭代 50 值 3283.179445
迭代 60 值 3249.518694
迭代 70 值 3248.163057
迭代 80 值 3248.129552
最终值 3248.128889
收敛的
警告信息:
在nominalTrainWorkflow(x = x, y = y, wts = weights, info = trainInfo, : 在重新采样的性能测量中存在缺失值。
出了点问题;缺少所有 ROC 指标值:
ROC Sens 规格
分钟。 : NA 分钟。 :0.01805 分钟。 :0.9946
第一区:NA 第一区:0.01805 第一区:0.9946
中位数:NA 中位数:0.01805 中位数:0.9946
平均值:NaN 平均值:0.01805 平均值:0.9946
第三曲:NA 第三曲:0.01805 第三曲:0.9946
最大限度。 : 不适用最大。 :0.01805 最大。 :0.9946
北美:3
train.default(x, y, weights = w, ...) 中的错误:停止
summaryFunction = twoClassSummary 似乎触发了警告。 它也发生在这里:
ctrl <- trainControl(method = "cv", summaryFunction = twoClassSummary)
multinomSummaryFit <- train(LoanStatus~., credit, method = "multinom", family=binomial,
trControl = ctrl)
Warning message:
In nominalTrainWorkflow(x = x, y = y, wts = weights, info = trainInfo, : There were missing values in resampled performance measures.
Something is wrong; all the ROC metric values are missing:
ROC Sens Spec
Min. : NA Min. :0.01919 Min. :0.9941
1st Qu.: NA 1st Qu.:0.01988 1st Qu.:0.9942
Median : NA Median :0.02056 Median :0.9943
Mean :NaN Mean :0.02011 Mean :0.9943
3rd Qu.: NA 3rd Qu.:0.02056 3rd Qu.:0.9943
Max. : NA Max. :0.02057 Max. :0.9944
NA's :3
Error in train.default(x, y, weights = w, ...): Stopping
【问题讨论】:
-
要增加对答案的更改,您可能希望将示例缩减到更易于管理的大小。在此过程中,您要么自己发现问题,要么最终得到一个可以通过
dput发布的小数据集。根据当前的描述,可能很难通过:检查数据的 NA、Inf 和 NaN。见stackoverflow.com/questions/5963269/… -
附加的 dput(head(credit,4))