如何查找哪些列会影响 R 中的预测答案

【问题标题】：How to find which columns affect a prediction in R如何查找哪些列会影响 R 中的预测
【发布时间】：2016-03-11 10:42:22
【问题描述】：

假设，我正在使用朴素贝叶斯在 R 中研究机器学习模型。因此，我将使用 naiveBayes 包构建模型，如下所示

model <- naiveBayes(Class ~ ., data = HouseVotes84)

我也可以通过打印模型来打印模型的重量。

我按如下方式进行预测，这给了我一个类作为预测

predict(model, HouseVotes84[1:10,], type = "raw")

但是，我的问题是，有没有办法查看哪些列对这个预测的影响最大？因此，我可以了解导致学生不及格的最重要因素是什么，例如，如果这是响应变量，并且各种可能的因素是其他预测变量列。

我的问题是针对 R 中的任何包，上面的 naiveBayes 只是一个示例。

【问题讨论】：

标签： r naivebayes

【解决方案1】：

答案取决于您希望如何处理feature selection。

如果它是模型构建过程的一部分，而不是一些事后分析，您可以使用 caret 及其 feature selection wrapper 方法来确定要使用递归特征消除、遗传算法等建模的最佳特征子集，或者使用单变量分析进行过滤。

如果它是仅基于您的预测的事后分析的一部分。然后这取决于您使用的模型类型。 caret 也只支持this functionality 兼容机型！

对于svm，除线性核外，确定系数的重要性很高non-trivial。我不知道有任何尝试对svm 进行某种功能排名的尝试，无论语言如何（请告诉我它是否存在！！）。

使用rpart（在问题中标记）您可以直观地查看节点。节点越高越重要。这可以在caret 包中完成：

library(rpart)
library(caret)
fit <- rpart(Kyphosis ~ Age + Number + Start, data = kyphosis)
caret::varImp(fit)
#        Overall
#Age    5.896114
#Number 3.411081
#Start  8.865279

使用naiveBayes，您可以从模型输出中看到它。你只需要非常努力地盯着看：

data(HouseVotes84, package = "mlbench")
model <- naiveBayes(Class ~ ., data = HouseVotes84)
model
#
#Naive Bayes Classifier for Discrete Predictors
#
#Call:
#naiveBayes.default(x = X, y = Y, laplace = laplace)
#
#A-priori probabilities:
#Y
#  democrat republican 
# 0.6137931  0.3862069 
#
#Conditional probabilities:
#            V1
#Y                    n         y
#  democrat   0.3953488 0.6046512
#  republican 0.8121212 0.1878788
#
#            V2
#Y                    n         y
#  democrat   0.4979079 0.5020921
#  republican 0.4932432 0.5067568

一目了然，至少V1 看起来比V2 更好。

【讨论】：

谢谢。但所有这些都是针对整个模型的。我想看看哪些列会影响测试数据集中某一行的预测。我的意思是，假设我对测试数据集中的一行的模型使用预测函数，它给了我一个特定的预测，我想看看哪些列最能导致预测。输出（每一行的贡献因素应该不同）
这绝对是模型相关的，例如，像朴素贝叶斯这样的模型，你可以通过查看模型信息再次弄清楚，因为假设每个变量都是独立的，对于决策树你必须逐案解决，因为决策树预测高度依赖于所采用的“路径”。不幸的是，我不知道有一些通用的方法可以做到这一点。除非您指的是简单的单变量分析。
嗨@chappers，我希望你做得很好，如果你不介意我们怎么知道在朴素贝叶斯分类器中 V1 是比 V2 更好的变量？是因为 0.3953488 + 0.8121212 > 0.4979079 + 0.4932432？如果是这样，这里的 n 和 y 代表什么？提前致谢。
看来 V1 比 V2 辨别力更好。