绘制树时间线（进化历史）

Question

我目前正在写一篇文献综述，我希望能够通过绘制我读过的论文来绘制一些算法的演变，以及它们通过引用作为水平树的联系，并有 x -轴对应于发布日期。

这是我正在寻找的示例。

问题

• 这种类型的图叫什么？
• 是否有现有的工具或示例可以生成这种类型的图表？

理想情况下，我想在 R 中或使用 D3.js 来实现这一点，但我很灵活。

注意：来自Cross Validated的交叉帖子

Answer 1

您所追求的可视化类型称为“分支图”，用于分支学或基于共享特征的生物分类。应用进一步分类的其他类似可视化被称为“系统图”或“系统发育树”。

在快速谷歌之后，我找到了this R package、ggtree，这似乎可以满足您的需求（分支树和标记 x 轴甚至 y 轴的潜力，如果您需要）。这个包似乎也允许高度可定制的绘图。祝你好运！