randomForest::importance() : type=2 有效，但 type=1 无效

Question

我正在使用 randomForest 包。为了获得可变的重要性，我使用了importance() 函数。 我想更改重要性度量的类型。它由“type”参数确定，它有 2 个可能的值：type=1 或 type=2。这是一个例子：

library(randomForest)

Y = runif(100, 0.0, 1.0)
X1 = runif(100, 0.0, 1.0)
X2 = runif(100, 0.0, 1.0)

rf.model = randomForest::randomForest(Y~X1+X2)

# type 2 : mean decrease in node impurity
imp2 = randomForest::importance(x=rf.model,type=2)

# type 1 : mean decrease in accuracy
imp1 = randomForest::importance(x=rf.model,type=1)

imp2 输出：

      IncNodePurity
X1      3.130248
X2      3.023091

imp1 输出：

X1
X2

如您所见，type=2（平均降低节点杂质）有效，但不是 type=1（平均降低准确性）。你知道如何解决这个问题吗？

Answer 1

你必须先在你的模型中启用它

rf.model = randomForest::randomForest(Y~X1+X2,importance=T)

然后它会工作。