线性回归图解释

Question

我有一个显示某些数据频率的直方图。 我有两种类型的文件：Pdbs 和 Uniprots。每个 Uniprot 文件都与一定数量的 Pdb 相关联。所以这个直方图显示有多少 Uniprot 文件与 0 个 Pdb 文件、1 个 Pdb 文件、2 个 Pdb 文件……80 个 Pdb 文件相关联。 Y 轴采用对数刻度。

我对同一数据集进行了回归，这就是结果。

这是我用于回归图的代码：

# Fitting Simple Linear Regression to the Training set
from sklearn.linear_model import LinearRegression
regressor = LinearRegression()
x = np.array(x).reshape((-1, 1))
y = np.array(y)
regressor.fit(x, y)

# Predicting the Test set results
y = regressor.predict(x)

# Visualizing the Training set results
plt.scatter(x, y, color = 'red')
plt.plot(x, regressor.predict(x), color = 'blue')
plt.title('Uniprot vs Pdb')
plt.xlabel('Pdbs')
plt.ylabel('Uniprot')
plt.savefig('regression_test.png')
plt.show()

你能帮我解释一下回归图吗？ 我可以理解，随着 Pdb 数量的增加，与它们相关的 Uniprots 将会减少。 但为什么它在 y 轴上变为负数？这正常吗？

Answer 1

解释这个线性回归的正确方法是“这个线性回归 90% 是没有意义的”。事实上，这 90% 中的一些比毫无意义更糟糕，这完全是误导，正如您用负面的 y 值指出的那样。 OTOH，其中大约 10% 的内容我们可以解释得很好，但你必须知道你在寻找什么。

原因： 除了其他通常不太明显的事情外，线性回归模型的假设之一是数据或多或少是线性的。如果您的数据与添加了一些 非常 常规“噪音”的数据不是线性的，那么所有的赌注都会被取消。您的数据不是线性的。他们甚至不接近。所以所有的赌注都没有了。

由于所有的赌注都没有了，因此检查一下我们原本可能想用线性回归模型做的事情会很有帮助。 最难的事情是extrapolation，它预测y 超出原始x 范围。您的模型在外推方面的能力很好地说明了它在端点处的行为。这是您注意到“嘿，我的图表都是负数！”的地方。从非常简单的意义上讲，这是因为您采用了一个线性模型，将其拟合到不满足“线性”假设的数据，然后尝试使其做模型最难做的事情。模型要做的第二件最难的事情是interpolation，它在原始x 范围内进行预测。这种线性回归也不是很擅长。再往下看，如果我们只看线性回归线的斜率，我们就可以大致了解我们的数据是增加还是减少。请注意，如果您的数据不是线性的，即使这个赌注也被取消。但是，对于大型甚至非线性的现实世界数据，它通常以一种并非完全无用的方式工作。所以，这一件事，你的线性回归模型有点正确。你的数据在减少，线性模型也在减少。这就是我之前所说的 10%。

怎么做：尝试拟合更好的模型。您说您对原始数据进行了日志转换，但看起来并没有太大帮助。一般来说，“转换”数据的全部意义在于使其看起来是线性的。日志转换对exponential 数据很有帮助。如果您的起始数据看起来不像指数，那么对数转换可能无济于事。由于您正在尝试执行density estimation，因此您几乎肯定希望将概率分布拟合到这些东西，您甚至不需要进行转换以使数据线性化。 Here 是另一个 Stack Overflow 答案，其中包含有关如何将 beta 分布拟合到数据的详细信息。但是，有很多选择。

Answer 2

你能帮我解释一下回归图吗？

线性回归尝试在 x 变量和目标 y 变量之间建立一条线，它以最封闭的方式同化“真实”值（您还可以在此处找到图表：https://en.wikipedia.org/wiki/Linear_regression）：

这里的线是蓝线，原点是黑线。目标是最小化所有黑点的误差（黑点到蓝线）。

回归线是蓝线。这意味着您可以使用线性方程 y = m*x +b 来描述一个 uniprot，它具有一个常数值 m=0.1（示例）和 b=0.2（示例）和 x=Pdbs。

我可以理解，随着 Pdb 数量的增加，与之关联的 Uniprot 将会减少。但是为什么它在 y 轴上是负数呢？

这是正常的，您可以将这条线绘制到 -10000000 Pdbs 或其他任何值，这只是一个等式。不是真正的线。

但是你的情节有一个错误，你需要把原来的黑点也画出来吗？

y = regressor.predict(x)
plt.scatter(x, y, color = 'red')

这是错误的，您应该向其中添加原始值，以从我的图形中获取情节，例如：

y = df['Uniprot']
plt.scatter(x, y, color = 'red')

应该有助于理解它。