如何读取带反斜杠的 DICOM 字符串值（VR=LO，Value="0.4323\0.2325"）？答案

【问题标题】：How to read DICOM string value with backslash (VR=LO, Value="0.4323\0.2325")?如何读取带反斜杠的 DICOM 字符串值（VR=LO，Value="0.4323\0.2325"）？
【发布时间】：2020-07-30 13:59:54
【问题描述】：

我们的 C++ 软件使用 ITK 来编写 DICOM 文件。在其中，我们有一个私有标签，其中LO（长字符串）为VR，2 个十进制值作为0.3234\0.34223 之类的值。

LO 选项是 ITK 固有的。

在其他 java 应用程序中，我使用 dcm4che3 来读取/写入它们。由于它尊重 DICOM 协议，因此禁止使用反斜杠，dcm4che 将值解释为"0.3234"，并且永远不会达到第二个值。

我使用的所有 DICOM 查看器应用程序都可以显示此值。

所以我的问题是：尽管存在反斜杠，但在 dcm4che 中是否有将这个完整值读取为字符串 "0.3234\0.34223" 的技巧？

下面是我使用的代码：

     public DicomInfo uploadFile(MultipartFile file) throws IOException, ParseException {

       DicomInfo infos = new DicomInfo();

       Attributes attrs = readDicomAttributes(file);
       infos.setTags(toAttributesObject(attrs).toString());
    }

    private static JsonObject toAttributesObject(Attributes targetSeriesAttrs) 
    {
       StringWriter strWriter = new StringWriter();
       JsonGenerator gen = Json.createGenerator(strWriter);
       JSONWriter writer = new JSONWriter(gen);
       writer.write(targetSeriesAttrs);
       gen.flush();
       gen.close();
       return Json.createReader(new 
          StringReader(strWriter.toString())).readObject();
  }
  
  public Attributes readDicomAttributes(MultipartFile file) throws IOException 
  {
    DicomInputStream dis = new DicomInputStream(file.getInputStream());
    Attributes dataSet = dis.readDataset(-1, Tag.PixelData);
    Attributes fmi = dis.readFileMetaInformation();
    dis.close();

    fmi.addAll(dataSet);

    return fmi;
  }

在我为这个标签得到的 JSON 中：

\"00110013\":{\"vr\":\"LO\",\"Value\":[\"0.4323\"]},

如您所见，它是 LO，第二部分已经丢失。

我获取具体属性的方法：

attr.getStrings(0x00110013)

发回一个只有一个值的表格，0.4323。

问题发生在 readDataSet 函数期间。

当我用免费的dicom viewer之类的软件打开标签时，我有完整的数据，所以数据就在这里。

好的，我找到了问题的根源......它是addAllfmi.addAll(dataSet);

在数据集中，getStrings 完美运行。在fmiaddAll之后，属性丢失了第二个值。

所以我的问题是现在解决这个addAll 问题：dcm4che3 java lib: Attributes.addAll method seems to lost multiple LO values

【问题讨论】：

反斜杠不是被禁止的，我猜你必须以某种方式告诉 dcm4che 你的私有属性的值多重性为 2。我不知道该怎么做，但通常会提到这个配置作为“私人词典”
in LO 反斜杠不应使用，请参阅文档，因此即使 getStringS 也不起作用。而且我无法修改 VR。
我认为唯一的解决方案是忘记 dcm4che 并在 java 中使用 ITK impl ...
我没有使用过 dcm4che，但快速浏览一下资料表明StringValueType.getStrings() 做了正确的事情，例如通过 '\' 分隔符拆分标签内容并返回字符串。你能展示你用来读取标签内容的代码吗？
我只是编辑以放置我的代码和结果

标签： java dicom dcm4che

【解决方案1】：

请参阅 Paolo 的回答，请相信我们反斜杠不违反 VR。正如他所说，该属性是二维，即它有VR LO 的两个值，由反斜杠分隔。

我对 dcm4che 项目及其背后的人有所了解，我几乎无法想象它通常无法处理这个问题。

我强烈怀疑您的问题与您的属性是 private 的事实有关。也就是说，如果没有任何关于标签及其值的附加信息，dcm4che（和任何其他产品）永远不会知道该属性的值被编码为 VR LO（长字符串）。

DICOM 中的默认传输语法是 Implicit Little Endian。这意味着，数据集不传达关于数据集中属性的 VR 的显式信息。该信息由属性的Tag隐式编码，必须使用数据字典（DICOM Part 6）查找标签并获取对应的VR。很明显，这仅适用于标准中定义的知名 DICOM 标签，而对于私有标签则无效。

因此，一种选择是尝试以显式小端序对数据集进行编码，这意味着 VR 是数据集中属性编码的一部分。我希望这已经足够了。

成熟的工具包（如 dcm4che）允许通过配置扩展数据字典，也就是说，您可以使用自定义标签定义来扩展 takeit 使用的“官方”数据字典 - 包括 VR .因此，在数据集本身没有明确给出 VR 的情况下，可以查找标签。

再次重申，我不是 dcm4che 的专家，但在 google 上快速搜索“dcm4che private dictionary”会得到this promising link。

我非常有信心您可以在 dcm4che 中解决问题，并且您不必迁移到其他工具包。

【讨论】：

据我了解，在显式小端序中编码数据集应该可以完成这项工作；不幸的是，OP没有明确提到它或评论他们是否尝试过这个。希望他们尝试一下并提出输出。
@AmitJoshi - 我实际上假设他们确实将其编码为 Explicit Little Endian，否则他们将不知道 VR - 但你是对的，这可能正是问题所在。否则完全同意 kritzel_sw。

【解决方案2】：

这个问题的解决方法是写

dataSet.addAll(fmi);
return dataSet;

而不是

fmi.AddAll(dataSet);
return fmi;

由于 addAll 方法丢失了多个私有 LO 值

【讨论】：

【解决方案3】：

LO 可以有多个值，用反斜杠分隔。

DICOM 标准规定，在 VR“LO”中，反斜杠不能用于值中，因为它用于分隔不同的元素。

在不允许多个元素的 VR 中，可以在值中使用反斜杠。

所以这里 dcm4che 是错误的。

【讨论】：