Python：pygraphviz 和 graphviz 的安装问题

Question

我看到很多关于在 Windows 上为 Python 2.7 正确安装 pygraphviz 和 graphviz 的困难的问题。但是我找到的答案没有解决我的问题。这是我所做的：

• 我首先使用非官方 Windows 二进制文件安装了 pygraphviz 在我的 anaconda (python) 文件夹中使用这个 link ( C:\Users\chamar\AppData\Local\Continuum\Anaconda)
• 下载graphviz-2.36.msi，默认安装 路径C:\Program Files (x86)\Graphviz2.36

Python 中的命令import pygraphviz 有效。但是当我想使用这个功能时nx.graphviz_layout 我得到raise ValueError("Program %s not found in path."%prog)

可能导致此问题的原因是pygraphviz 找不到graphviz 的路径。现在，由于我使用非官方的 Windows 二进制文件安装了pygraphviz，我可以修改哪个文件来链接library 和include 以获得graphviz 的路径？当您不使用非官方二进制文件时，您通常会在pygraphviz 的library 和include 路径中找到setup.py。

更新 1

我在SOFTWARE 下的Regedit 中的PATH 中添加了一个带有新key（默认）的文件夹GRAPHIZ，其值为C:\Program Files (x86)\Graphviz2.36\bin

更新 2

我在pydot.py 文件中遇到了关于 Python 难以定位 Graphviz 路径的错误。我做了如下更改：

def _graphviz():
    if os.sys.platform == 'win32':
        path = r"C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/bin/"
        progs = __find_executables(path)
        return progs

find_graphviz()
{'fdp': 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/bin/fdp.exe', 'twopi': 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/bin/twopi.exe', 'neato': 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/bin/neato.exe', 'dot': 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/bin/dot.exe', 'circo': 'C:/Program Files (x86)/Graphviz2.36/bin/circo.exe'}

这对我来说似乎没问题，但是当我执行时说：

positions = nx.graphviz_layout(G, prog='twopi', root=0)

我明白了：

    Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "C:\Users\chamar.stu\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_agraph.py", line 229, in graphviz_layout
    return pygraphviz_layout(G,prog=prog,root=root,args=args)
  File "C:\Users\chamar.stu\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\networkx\drawing\nx_agraph.py", line 264, in pygraphviz_layout
    A.layout(prog=prog,args=args)
  File "C:\Users\chamar.stu\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\pygraphviz\agraph.py", line 1305, in layout
    data=self._run_prog(prog,' '.join([args,"-T",fmt]))
  File "C:\Users\chamar.stu\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\pygraphviz\agraph.py", line 1251, in _run_prog
    runprog=r'"%s"'%self._get_prog(prog)
  File "C:\Users\chamar.stu\AppData\Local\Continuum\Anaconda\lib\site-packages\pygraphviz\agraph.py", line 1239, in _get_prog
    raise ValueError("Program %s not found in path."%prog)
ValueError: Program twopi not found in path.

为什么？

Answer 1

以下是我为使 pygraphviz 为 Python 3.4 工作所遵循的步骤（我认为如果你遵循类似的步骤，它应该适用于 Python 2.x）。我只是在这里记录它以供该页面的未来访问者使用：

先决条件：

1. wheel（应该默认出现在较新的发行版中）
2. pygraphviz (unofficial builds) 的正确 Windows 版本。在 Win7 x64 上，我选择了“pygraphviz‑$version-cp34‑none‑win_amd64.whl”。 （注意cp34表示python版本。）
3. Graphviz installer 2.38 版（上面的轮子是为此构建的）

步骤：

1. 运行 Graphviz 安装程序
2. 将 Graphviz\bin 文件夹添加到您的用户或系统路径中
3. 检查：打开命令提示符并执行twopi -V。您应该能够看到打印到控制台上的 Graphviz 版本。
4. 现在转到您的 Python 环境（例如，通过运行 anaconda.bat，您可以在其中运行 python 的提示符）
5. 运行pip install pygraphviz‑*$version*-cp34‑none‑win_amd64.whl
6. 你已经完成了:)！运行example script 以查看是否一切顺利。

Answer 2

您会在此站点上找到大量可安装的软件包：http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/，包括您尝试安装的软件包。我知道我回答得太晚了，但我刚刚成为会员。

Answer 3

您可以先安装“easy_install”（查看 How to use Python's "easy_install" on Windows ... it's not so easy) 那么需要 2 个包：“python-pygraph”和“libgv-python”。