我在哪里可以在 Mac 上添加 Graphviz 的可执行文件答案

【问题标题】：Where do I add Graphviz's Executable on a Mac我在哪里可以在 Mac 上添加 Graphviz 的可执行文件
【发布时间】：2019-07-24 19:20:52
【问题描述】：

我正在尝试使用Graphviz，但收到错误消息：

graphviz.backend.ExecutableNotFound: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test-output/aoc.gv.pdf'], make sure the Graphviz executables are on your systems' PATH

我正在运行的代码是从文档中剪切和粘贴的：

from graphviz import Digraph, Graph
dot = Digraph(comment='The Round Table')
dot.node('A', 'King Arthur')
dot.node('B', 'Sir Bedevere the Wise')
dot.node('L', 'Sir Lancelot the Brave')
dot.edges(['AB', 'AL'])
dot.edge('B', 'L', constraint='false')
dot.render('test-output/aoc.gv.pdf')

该文件将输出到正确的文件夹，该文件在那里，它有 170 个字节，但它不会打开。我已经尝试过其他扩展，例如“gv”，但它们也不起作用。我正在使用最新版本的Graphviz，它是 0.10.1，我尝试在 PC 上打开这个文件，但它在 PC 上也不起作用（我有一台 Mac）。这个问题类似于

Graphviz's executables are not found (Python 3.4)

和

Why is pydot unable to find GraphViz's executables in Windows 8?

但是，我理解这些帖子存在重大障碍。第一，我对 Python 是如何在计算机上执行的了解很少，所以我什至不知道环境变量是什么。其次，当他们提到计算机的 PATH 时，我只能假设他们正在谈论正在执行 Graphviz 模块的文件的目录，但我不确定。所以我添加了这行代码：

import sys
str1 = "/library/frameworks/python.framework/versions/3.6/lib/python3.6/site-packages/graphviz/"
sys.path.append(str1)

但这不起作用。第三，如果我要实现这一步：

将此字符串添加到变量值列表的末尾（包括分号）：;C:\Program Files (x86)\Graphviz2.34\bin

然后我必须将它翻译成它的 Mac 对应物，但我做不到。任何帮助将不胜感激。

【问题讨论】：

您是否安装了实际的 Graphviz（不是 python 包，而是实际的程序）？例如brew install graphviz?
阅读 linfo.org/path_env_var.html 以了解 PATH 的工作原理。 brew 通常会安装 /usr/local/bin 下的所有内容。
Homebrew 在哪里安装 Graphviz？我还没有找到一个包含这些重要信息的网站！它不在 /Applications 中。

标签： python-3.x graphviz

【解决方案1】：

我尝试了这些命令来帮助我在我的 Mac 上找到 DOT 文件路径。它不是：“/usr/local/bin/dot”在我的系统上。

dot -V

dot - graphviz version 2.49.2

which dot

/opt/homebrew/bin/dot

我已经安装了 Graphviz，但我仍然无法找到正确的路径。我正在使用 Protege，我不得不修改 OwlViz 的路径，因为它在 (0,0) 处显示整个层次结构。我将通过运行 which dot 命令获得的路径复制到首选项对话框上的 OWLViz 选项卡，然后重新启动 protege，它运行良好！祝你好运！

【讨论】：

【解决方案2】：

诊断表明 dot 不在您的 $PATH 中，它没有出现在该环境变量提到的任何目录中。您希望尝试以下命令会报告一些版本号：

$ dot -V
dot - graphviz version 2.40.1 (20161225.0304)
$
$ which dot
/usr/local/bin/dot
$
$ echo $PATH | tr : ' ' | fmt -w1 | grep local
/usr/local/bin

如果您还没有使用 Brew，那么您应该这样做。这是将这个程序和许多其他程序放到您的 Mac 上的最简单方法。访问https://brew.sh/ 并按照说明进行操作。然后输入：

$ brew install graphviz
...
$ /usr/local/bin/dot -V

这应该可以正常工作。如果dot -V 说“未找到”，那么只需将正确的目录附加到您的 PATH：

$ export PATH="${PATH}:/usr/local/bin"

如果你的 bash shell 可以运行它，那么你的 python 程序应该也可以。

【讨论】：

感谢您帮助我。我已经安装了自制软件，但这没关系，因为我不明白它是如何工作的。当我输入命令/usr/local/bin/dot -V 时，我收到错误消息：/usr/local/bin/dot: No such file or directory。当我输入export PATH="${PATH}:/usr/local/bin" 时，我没有收到错误消息，但程序无法运行。我尝试用 PATH 替换模块所在的路径：/Users/me/PycharmProjects/inference_engine2/inference2/proofs/other/ 但这给出了消息：bad substitution
听起来你的 Mac 上没有安装 dot。使用$ brew install graphviz将其安装在默认位置/usr/local/bin。
我输入了brew install graphviz，一切正常。我确实收到了这条消息 Error: The following directories are not writable by your user: /usr/local/share/man/man3 /usr/local/share/man/man5 /usr/local/share/man/man7 但我不确定这是否相关。
当我写信时：echo $PATH 我得到：/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/3.6/bin:/usr/local/bin/dot
简而言之，在文档中它说：“确保包含 dot 可执行文件的目录位于系统路径上。”我只是不明白这意味着什么。

【解决方案3】：

问题解决了。我花了一段时间才弄清楚我必须先下载一些非 Python 软件，然后才能让 Python 软件工作。

brew install graphviz

是第 1 步，我之前已经这样做了，但我收到了一条错误消息。它告诉我更改某些文件的所有权，所以我这样做了。然后尝试了

brew install graphviz

再次成功。

【讨论】：