R 有没有办法找到 Inf/-Inf 值？答案

【问题标题】：R is there a way to find Inf/-Inf values?R 有没有办法找到 Inf/-Inf 值？
【发布时间】：2012-01-31 03:56:24
【问题描述】：

我正在尝试在大型数据集 (5000x300) 上运行 randomForest。不幸的是，我收到如下错误消息：

> RF <- randomForest(prePrior1, postPrior1[,6]
+                    ,,do.trace=TRUE,importance=TRUE,ntree=100,,forest=TRUE)
Error in randomForest.default(prePrior1, postPrior1[, 6], , do.trace = TRUE,  : 
  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 1)

所以我尝试使用以下方法查找任何 NA：

> df2 <- prePrior1[is.na(prePrior1)]
> df2 
character(0)
> df2 <- postPrior1[is.na(postPrior1[,6])]
> df2 
numeric(0)

这让我相信问题出在 Inf 上，因为似乎没有任何 NA。

关于如何根除 Inf 的任何建议？

【问题讨论】：

不一定是Inf。正如错误所说，它也可能是NaN。无论如何，?Inf 会回答您的问题。

标签： r random-forest na

【解决方案1】：

您可能正在寻找 is.finite，尽管我不能 100% 确定问题出在您输入数据中的 Infs。

请务必仔细阅读is.finite 的帮助，了解它会识别出哪些缺失、无限等组合。具体来说：

> is.finite(c(1,NA,-Inf,NaN))
[1]  TRUE FALSE FALSE FALSE
> is.infinite(c(1,NA,-Inf,NaN))
[1] FALSE FALSE  TRUE FALSE

其中一件事情与其他事情不同。毫不奇怪，还有一个 is.nan 函数。

【讨论】：

一般来说，randomForest 中关于 NA/NaN/Inf 的警告不是由 NA/NaN/Inf 引起的，实际上是由字符数据引起的。

【解决方案2】：

randomForest 的 'NA/NaN/Inf in foreign function call' 通常是一个错误警告，真的很烦人：

如果传递的任何变量是字符，你就会得到这个
实际的 NaN 和 Infs 在干净的数据中几乎不会发生

我的快速而肮脏的技巧来缩小范围，对变量列表进行二进制搜索，并使用像 ntree=2 这样的标记参数来获得变量子集的即时通过/失败：

RF <- randomForest(prePrior1[m:n],ntree=2,...)

【讨论】：

【解决方案3】：

类似于is.na，您可以使用is.infinite 查找无穷大的出现。

【讨论】：

【解决方案4】：

看看with，例如：

> with(df, df == Inf)
        foo   bar   baz   abc ...
[1,]  FALSE FALSE  TRUE FALSE ...
[2,]  FALSE  TRUE FALSE FALSE ...
...

【讨论】：

【解决方案5】：

joran 的答案是您想要的并且内容丰富。有关is.na() 和is.infinite() 的更多详细信息，请查看https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/Matrix/html/is.na-methods.html 此外，在你得到逻辑向量后，说明原始向量的每个元素是否为 NA/Inf，你可以使用which() 函数来获取索引，就像这样：

> v1 <- c(1, Inf, 2, NaN, Inf, 3, NaN, Inf)
> is.infinite(v1)
[1] FALSE  TRUE FALSE FALSE  TRUE FALSE FALSE  TRUE
> which(is.infinite(v1))
[1] 2 5 8
> is.na(v1)
[1] FALSE FALSE FALSE  TRUE FALSE FALSE  TRUE FALSE
> which(is.na(v1))
[1] 4 7

which() 的文档在这里https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/any.html

【讨论】：