具有 NaN 值的随机森林答案

【问题标题】：random forest with NaN values具有 NaN 值的随机森林
【发布时间】：2017-04-17 15:43:06
【问题描述】：

如果某些预测变量的列中有 NaN 值，我如何使用 randomForest 库在 R 中运行随机森林。

rf <- randomForest(class ~ maxf + minf + d + startf + endf + f1.4 + f1.2 + f3.4 + minslope + maxslope+ bslope + eslope + avgsl + noex + noip, data=whistles_nov, importance=TRUE)

给出这个错误：

Error in na.fail.default(list(class = c(6L, 6L, 6L, 6L, 6L, 6L, 6L, 6L,  : 
missing values in object

matlab 中的 TreeBagger 函数是否与 NaN 值无关？

【问题讨论】：

首先使用 rfImpute 估算 mssing 值
我会使用适当的插补方法（或者如果可以接受，则删除具有 NaN 值的行）来运行它。如果它是一个类变量，您可能只需添加一个新的“缺失”类别。如果您在多个数值列中有大量缺失值，则可能会因为随机森林的工作方式而变得复杂。

标签： r matlab cart random-forest

【解决方案1】：

您应该“阅读免费手册”(link) 当您键入“?randomForest”时，在 r/rstudio 中也应该可以使用关键字“randomForest”下显示的第 17 页相同的材料。

注意上面写着“na.action”。那里的设置应该驱动它以更理想的方式处理“NA”值。默认值也突出显示，表示“na.fail”。

第 21 页给出的示例之一使用“na.omit”。我怀疑这会省略具有 na 值的行。

您也可以考虑使用缺失值插补将其替换为非 NA 值，但您必须确定这样做是否正确。 (link)

从这个 (link) 看来，MatLab 默认使用“na.omit”的一些有效变体。

【讨论】：