查找 .mat 文件之间的所有差异

Question

我正在寻找一种方法来列出两个 .mat 文件之间的差异，这对许多人来说可能很有用。

虽然我到处搜索我能想到的，但我没有找到任何符合我要求的东西：

1. 选择 2 个 mat 文件
2. 找出差异
3. 妥善保存

我最接近的是visdiff。只要我留在matlab中，它就可以让我浏览差异，但是当我保存结果时，它只显示顶级。

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这是我的文件通常看起来的简化示例：

a = 6;
b.c.d = 7;
b.c.e = 'x';
save f1
f = a;
clear a
b.c.e = 'y';
save f2
visdiff('f1.mat','f2.mat')

如果我点击这里b，我可以找到不同之处。但是，如果我运行它并使用“文件>保存”，我将无法单击 b。因此，我仍然不知道发生了什么变化。

注意：我没有 Simulink

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因此我的问题是：

如何向没有 Matlab 的人展示 2 个 mat 文件之间的所有差异

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以下是我个人认为最适合不同情况的答案：

• Answer for users with Simulink
• General answer
• Answer displaying all value differences

Answer 1

找出没有 MATLAB 的 mat 文件之间的所有差异？

您可以找到基于.mat files 的HDF5 与HDF5 Tools 之间的区别。

示例

让我缩短您的 MATLAB 示例并假设您使用

创建了两个 mat 文件

clear ; a = 6 ; b.c = 'hello' ; save -v7.3 f1
clear ; a = 7 ; b.e = 'world' ; save -v7.3 f2

在 MATLAB 之外使用

h5ls -v -r f1.mat

获取有关包含 f1.mat 的数据类型的列表：

Opened "f1.mat" with sec2 driver.
/                        Group
    Location:  1:96
    Links:     1
/a                       Dataset {1/1, 1/1}
    Attribute: MATLAB_class scalar
        Type:      6-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "double"
    Location:  1:2576
    Links:     1
    Storage:   8 logical bytes, 8 allocated bytes, 100.00% utilization
    Type:      native double
/b                       Group
    Attribute: MATLAB_class scalar
        Type:      6-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "struct"
    Location:  1:800
    Links:     1
/b/c                     Dataset {5/5, 1/1}
    Attribute: H5PATH scalar
        Type:      2-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "/b"
    Attribute: MATLAB_class scalar
        Type:      4-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "char"
    Attribute: MATLAB_int_decode scalar
        Type:      native int
        Data:  2
    Location:  1:1832
    Links:     1
    Storage:   10 logical bytes, 10 allocated bytes, 100.00% utilization
    Type:      native unsigned short

使用

h5ls -d -r f1.mat

返回存储数据的值：

/                        Group
/a                       Dataset {1, 1}
    Data:
        (0,0) 6
/b                       Group
/b/c                     Dataset {5, 1}
    Data:
        (0,0) 104, 101, 108, 108, 111

数据104, 101, 108, 108, 111代表单词hello，可以用

h5ls -d -r f1.mat | tail -1 | awk '{FS=",";printf("%c%c%c%c%c \n",$2,$3,$4,$5,$6)}'

您可以获得 f2.mat 的相同列表，并将两个输出与您选择的工具进行比较。

Comparison 也可以直接与HDF5 Tools 一起使用。要比较两个文件中的两个数字a，请使用

h5diff -r f1.mat f2.mat /a

这将向您显示值及其差异

dataset: </a> and </a>
size:           [1x1]           [1x1]
position        a               a               difference          
------------------------------------------------------------
[ 0 0 ]          6               7               1              
1 differences found
attribute: <MATLAB_class of </a>> and <MATLAB_class of </a>>
0 differences found

备注

HDF5 Tools 中有更多命令和选项，可能有助于解决您的实际问题。

可从The HDF Group 获得适用于 Linux 和 Windows 的二进制发行版。对于 OS X，您可以通过 MacPorts 安装它们。如果需要，还有一个 GUI：HDFView。

Answer 2

如果您有 simulink，您可以使用 Simulink.saveVars 生成一个 m 文件，该文件在执行时会在工作空间中创建相同的变量：

a = 6;
b.c.d = 7;
b.c.e = 'x';
Simulink.saveVars('f1');
f = a;
clear a
b.c.e = 'y';
Simulink.saveVars('f2');
visdiff('f1.m','f2.m')

如本截图所示

请注意，默认情况下，它将数组中的元素数限制为 1000，您可以将其增加到 10000。大于该限制的数组将保存在单独的 mat 文件中。

更新：从 R2014a 开始，一个类似于 Simulink.saveVars 的新函数已添加到 MATLAB。见matlab.io.saveVariablesToScript

Answer 3

这只是部分答案，但也许有帮助。

您可以使用gencode，这是一个从变量生成 Matlab 代码的 Matlab 函数，以便运行代码重现变量。您对每个 mat 文件中的所有变量执行此操作（需要一些编程，但应该可行）并将结果放入不同的 .m 文件中。

然后您使用标准文本比较工具（甚至可能是visdiff）来比较 .m 文件。

Answer 4

有几个很好的工具可以比较 XML 文件，我会这样处理：

1. 下载struct2xml.m
2. 加载两个 matfile
3. 用 struct2xml 导出每个
4. 比较，使用 XMLSpy 或类似方法

Answer 5

简单的通用答案，不显示价值差异

由于我从@BHF、@Daniel R 和@Dennis Jaheruddin 的回答中获得的洞察力，我设法找到了一个简单的可扩展解决方案：

[fs1, fs2, er] = comp_struct(load('f1.mat'),load('f2.mat'))

请注意，它适用于包含任意数量变量的 .mat。

这使用Compare Structures - File Exchange submission。

Answer 6

小文件的答案，显示所有值差异

根据@A 的建议。 Donda 我尝试使用gencode 为所有内容创建一个变量。

虽然它适用于我的玩具示例，但速度很慢，并告诉我超出了真实 .mat 文件允许的变量数量。

无论如何，对于那些正在寻找适用于小文件的东西的人，我会发布这个选项：

wList=who;
for iLoop = 1:numel(wList)
    eval(['generated_' wList{iLoop} '= gencode(' wList{iLoop} ');'])
    for jLoop = 1:numel(eval(['generated_' wList{iLoop}]))
        eval(['generated_' wList{iLoop} '_' num2str(jLoop) '= generated_' wList{iLoop} '(' num2str(jLoop) ');' ])
    end
end

虽然它可能有效，但我觉得这不是最好的方法。

Answer 7

一般答案，不显示价值差异

由于我从@BHF 和@Daniel R 的答案中获得的洞察力，我设法找到了一个可合理扩展的解决方案。

第 1 步：将每个文件中的所有变量保存为单个结构

这使用Save workspace to struct - File Exchange submission。

假设您要比较 f1.mat 和 f2.mat，请执行以下步骤：

clear
load f1
myStruct1 = ws2struct;
save myStruct1 myStruct1 
clear
load f2
myStruct2 = ws2struct;
save myStruct2 myStruct2 
clear                    
load myStruct1
load myStruct2

第 2 步：比较结构

这使用Compare Structures - File Exchange submission

鉴于您想比较myStruct1 和myStruct2，您只需调用：

[fs1, fs2, er] = comp_struct(myStruct1,myStruct2)

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我对@9​​87654329@ 中差异列表的可读性感到非常惊讶，这是问题中使用的示例的输出：

呃 =

's2 is missing field a'
's1(1).b(1).c(1).e and s2(1).b(1).c(1).e do not match'

请注意，它不会显示值，从技术角度来看，如果需要显示值差异，更改 m 文件可能并不难。但是，特别是如果有一些大矩阵，我认为这可能会导致输出有问题。