【发布时间】：2014-09-30 23:16:05
【问题描述】：
我需要对我以 FASTA 格式下载的 DNA 序列（核苷酸）序列执行 K 均值聚类和层次聚类。所以在执行聚类之前，我需要对 bases(a,t,c,g) 进行十进制编码.. 那么怎么做.. 这样我就可以在 MATLAB 中以矩阵形式获取这个输入？。
【问题讨论】：
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你有 Matlab 的生物信息学工具包吗？它可以直接加载FASTA。
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是的先生，我有 MATLAB 生物信息学工具包，但是为了执行 kmeans 聚类，我不需要数值数据.. 为此我需要将 a、c、t、g 转换为十进制值.. 如何这样做.. 还是直接加载 FASTA 文件我可以对这些 fasta 文件执行聚类？
标签： k-means hierarchical-clustering dna-sequence