如何压缩保存在 hdf5 中的数据？答案

【问题标题】：How to compress the data that saved in hdf5?如何压缩保存在 hdf5 中的数据？
【发布时间】：2018-02-26 22:57:29
【问题描述】：

我正在使用 python 2.7 读取视频并存储在 hdf5 中。这是我的代码

import h5py
import skvideo.datasets
import skvideo.io
videodata = skvideo.io.vread('./v_ApplyEyeMakeup_g01_c01.avi')
with h5py.File('./video.hdf5','w') as f:
    f['data'] = videodata
    f['label'] = 1

问题是输出的hdf5太大了。它比原始的 avi 文件大 128 倍。我应该怎么做才能压缩/减小尺寸？您可以在https://drive.google.com/open?id=0B1MrjZsURl2yNFM0ZTJfZ3pOZVU下载文件

我认为我们可以使用压缩它

f.create_dataset('data',data=videodata,compression='gzip',compression_opts=9)
f.create_dataset('label', data=1)

现在，它仍然是原始文件的 37 倍。提前致谢。

【问题讨论】：

您好，尝试沿时间维度添加分块，应该可以提高压缩率。
能否根据我的代码提供代码

标签： python python-2.7 hdf5 h5py

【解决方案1】：

通过添加分块，我能够使输出为 7.2M，而没有时为 10M。所以它肯定会有所改善，但仍远非专用视频格式。您可以使用来自https://support.hdfgroup.org/services/filters.html 的其他过滤器，但我怀疑它们是否会将压缩提高一个数量级。所以如果你想继续使用 h5py，你可能需要接受更大的文件大小。如果这不可接受，请尝试其他文件格式。

import h5py
import skvideo.datasets
import skvideo.io
videodata = skvideo.io.vread('./v_ApplyEyeMakeup_g01_c01.avi')

print(videodata.shape)
with h5py.File('./video.hdf5','w') as f:
    f.create_dataset('data',
                      data=videodata,
                      compression='gzip',
                      compression_opts=9,
                      chunks=(164, 20, 20, 3))
    f.create_dataset('label', data=1)

【讨论】：

【解决方案2】：

您的问题应该使用适合您的视频文件的编码来解决。根据您的业务，有各种编码算法，例如 x265 可以压缩视频，但需要大量资源才能做到这一点。看看here。

最近我听说了另一个有趣的编码，它很适合在线流媒体，叫做 Daala，你可以在here 获得更多信息。

通常这取决于您对编码的期望，但选择一个好的编码器是您应该走的路，尝试搜索。

【讨论】：