HDF5 C 代码生成答案

【问题标题】：HDF5 C Code generationHDF5 C 代码生成
【发布时间】：2012-06-26 04:40:36
【问题描述】：

我想知道是否有工具能够从 C 数据结构生成 C HDF5 读写代码。

我希望该工具能够解析 C 头文件并生成相应的 C HDF5 读/写代码。

可以区分静态分配和动态分配的情况。第一次，我只对静态分配感兴趣。

例如，我想根据结构体 sensor_t 的定义生成以下代码，其中包含一个 int 和两个 double。显示的代码是 typedef C 结构到 C HDF5 结构的直接转换。

typedef struct {
    int     serial_no;
    double  temperature;
    double  pressure;
} sensor_t;

#include "hdf5.h"
hid_t memtype;
herr_t      status;
memtype = H5Tcreate (H5T_COMPOUND, sizeof (sensor_t));
status = H5Tinsert (memtype, "serial_no",    HOFFSET (sensor_t, serial_no), H5T_NATIVE_INT);
status = H5Tinsert (memtype, "temperature",  HOFFSET (sensor_t, temperature), H5T_NATIVE_DOUBLE);
status = H5Tinsert (memtype, "pressure",     HOFFSET (sensor_t, pressure), H5T_NATIVE_DOUBLE);


sensor_t    wdata[1];
status = H5Dread (dset, memtype, H5S_ALL, H5S_ALL, H5P_DEFAULT, rdata);
status = H5Dwrite (dset, memtype, H5S_ALL, H5S_ALL, H5P_DEFAULT, wdata);

我看了hdf网站没有成功

http://www.hdfgroup.org

我知道有些人尝试过使用 Perl 脚本的 HDF4

http://www.srl.caltech.edu/ACE/ASC/exhdfgen/index.htm

【问题讨论】：

标签： c api code-generation hdf5

【解决方案1】：

有趣。在 NetCDF 土地上有 "ncgen"。 NetCDF-4 引入了复合类型的概念。 NetCDF4 也可以使用 HDF5 文件格式作为底层容器格式。

因此，它不需要 C 头文件，但“CDL”标记非常简单：

netcdf demo {
types:
  compound mything {
    int id ;
    double d1 ;
    double d2 ;
  }; // mything
dimensions:
        d1 = 1 ;
variables:
        mything v1(d1) ;

// global attributes:

然后你可以用它来制作 netcdf C 代码：

ncgen -c mine.cdl

这不是你想要的。这根本不是你想要的，但它可能是你现在能得到的最接近的。

【讨论】：