如何在R中附加多个文件答案

【问题标题】：How to append multiple files in R如何在R中附加多个文件
【发布时间】：2016-02-07 12:08:43
【问题描述】：

我正在尝试读取文件列表并将它们附加到包含所有记录的新文件中。我不打算更改原始文件中的任何内容。我已经尝试了几种方法。

方法 1： 此方法会创建一个新文件，但在每次迭代时都会再次添加前一个文件。因为我是递归绑定数据框的。

files <- list.files(pattern = "\\.csv$")

  #temparary data frame to load the contents on the current file
  temp_df <- data.frame(ModelName = character(), Object = character(),stringsAsFactors = F)

  #reading each file within the range and append them to create one file
  for (i in 1:length(files)){
    #read the file
    currentFile = read.csv(files[i])

    #Append the current file
    temp_df = rbind(temp_df, currentFile)    
  }

  #writing the appended file  
  write.csv(temp_df,"Models_appended.csv",row.names = F,quote = F)

方法2：我从Rbloggers得到这个方法。此方法不会写入新文件，但会继续修改原始文件。

multmerge = function(){
  filenames= list.files(pattern = "\\.csv$")
  datalist = lapply(filenames, function(x){read.csv(file=x,header=T)})
  Reduce(function(x,y) {merge(x,y)}, temp_df)

}

有人可以建议我如何实现我的目标吗？

【问题讨论】：

标签： r file csv append

【解决方案1】：

现在rbind_list() 有一个简单的答案！

例如：

dataFiles = map(Sys.glob("*.csv"), read.csv)

或者您正在将文件读入列表

dat = rbind_list(dataFiles)

dat 将是您正在寻找的内容！

【讨论】：

你的意思是data.table::rbindlist()？
你的意思是dataFiles = purrr::map(Sys.glob("*.csv"), read.csv)？

【解决方案2】：

为您的 ListOfFileNames 试试这个：

ListOfFileNames<-list.files(pattern=".txt")
outFile <- file("all.txt", "w")
for (i in ListOfFileNames){
    x <- readLines(i)
    writeLines(x, outFile) # in the link the 1st and last line are skipped
}
close(outFile)

来源：https://r.789695.n4.nabble.com/R-Read-multiple-text-files-and-combine-into-single-file-td817344.html

【讨论】：

【解决方案3】：

或者你可以继续在 R 中使用 shell 命令：

system2("cat", args = "*.csv", stdout = "appendedfiles.csv")

这适用于基于 unix 的系统；我不确定你会为 windows 做什么。

【讨论】：

【解决方案4】：

它可能看起来像这样：

files <- list.files(pattern = "\\.csv$")

DF <-  read.csv(files[1])

#reading each file within the range and append them to create one file
for (f in files[-1]){
  df <- read.csv(f)      # read the file
  DF <- rbind(DF, df)    # append the current file
}
#writing the appended file  
write.csv(DF, "Models_appended.csv", row.names=FALSE, quote=FALSE)

或简称：

files <- list.files(pattern = "\\.csv$")

DF <-  read.csv(files[1])
for (f in files[-1]) DF <- rbind(DF, read.csv(f))   
write.csv(DF, "Models_appended.csv", row.names=FALSE, quote=FALSE)

【讨论】：

【解决方案5】：

您可以使用它来将所有内容加载到一个数据集中。

dataset <- do.call("rbind", lapply(file.list, FUN = function(file) {
  read.table(file, header=TRUE, sep="\t")
}))

然后只需使用write.csv 保存即可。

【讨论】：