【问题标题】:How to create a wrapper for a Matrix class to Numpy with SWIG?如何使用 SWIG 为 Numpy 的 Matrix 类创建一个包装器?
【发布时间】:2013-04-22 15:57:21
【问题描述】:

我有一个古老的 C++ 库,其中包含一个 Matrix 类和大量使用它的代码。基本上是

class Matrix {
  double* p;      // the actual data
  int nd;         // number of dimensions
  int d0, d1, d2; // the actual dimensionality

  // ... (a whole lot of functions computing various things, like SVDs, dotproduct etc.
}

现在我们使用 SWIG 编写一个 python 包装器。我们想在 python 端使用 NumPy 数组来保持与世界其他地方的兼容性。所以我们实际上不需要我们的 C++ 矩阵类的功能,但是我们想使用我们库的一些其他部分,它需要这个 C++ 矩阵。所以完美的情况是,如果我们可以将一个类型映射从一个 NumPy 数组写入我们的 Matrix 类,它会在每次调用时透明地转换一个 NumPy 数组并保持内存同步。假设我们的库中有一些函数,它是 swigged:

int some_function(Matrix& in) { /* do some stuff */ }

如果在 python 中我们可以做类似的事情,那就太好了:

a = numpy.array[1,2,3,4]
b = some_function(a)

我知道有 numpy.i,但这似乎更多地是关于函数映射和普通的旧 C 数组。我也明白 typemap 应该完成我想要的,但我真的不明白我如何才能真正访问 numpy 数据。有没有(相对)简单的方法可以做到这一点?

我也希望能提供一些教程。

【问题讨论】:

    标签: c++ numpy swig


    【解决方案1】:

    根据您提供的信息,类型图可以工作。但是我作为一个间歇性的 SWIG 用户(通常是几周内我经常使用它,然后中断到下一个项目/阶段)的经验是,很少有人有时间去了解这个功能。

    在你的情况下,我认为 SWIG 类型图比要求更方便,所以我会使用以下两种方法之一:

    1. 创建一个 Python 函数,将 numpy.array 转换为 Matrix(Matrix 是 SWIG 从 C++ 导出到 Python 的函数)
    2. 使用内置的 numpy.i 类型映射来调用在该类型映射中接受 C++ 类型的 C++ 函数,并定义该函数以调用 int some_function(Matrix& in)

    选项 1 的优点是您可以通过重新绑定 Python 函数来自动进行转换:

    old_some_func = some_function
    def some_function(numpy_array):
        tempMat = Matrix()
        # convert numpy_array to SWIG'd Matrix class
        old_some_func(tempMat)
    

    这样做对性能的影响可能可以忽略不计,但您应该进行测试。如果没有 SWIG(即如果您使用 C API),此技术将具有额外的优势,即不需要您更改 C++ 库(请参阅 SWIG 的扩展指令)。

    选项 2 的优点是转换是 C/C++ 级别的,因此根据所涉及的内容,您可能会获得改进的性能。假设 numpy.i 类型映射之一将 numpy.array 映射到 float[numValues] 数组,并且您的 C++ 矩阵包含单精度浮点值。在这种情况下,您在项目的 .i 文件中定义 C++ some_function(float*, numValues),该函数调用 some_function(Matrix)。检查您的 C++ Matrix 类是否可以存储指向数组数据的指针,这样您将避免跨一层甚至两层复制数据(Python -> SWIG some_function(array) -> some_function(Matrix))。

    但请记住:您在 C++ some_function 中的计算可能会使这两个选项之间的任何性能差异变得微不足道。你必须测试。然后选择最简单和最易于维护的那个(可能是选项 1)。

    【讨论】:

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