安装 BRugs 时出错“C 编译器无法创建可执行文件”答案

【问题标题】：error installing BRugs "C compiler cannot create executables"安装 BRugs 时出错“C 编译器无法创建可执行文件”
【发布时间】：2012-08-22 17:08:31
【问题描述】：

我正在尝试在我的 Ubuntu 12.04 桌面上安装 R 库 BRugs。

> sessionInfo()
R version 2.15.1 (2012-06-22)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

但我收到以下错误：

* installing *source* package ‘BRugs’ ...
** package ‘BRugs’ successfully unpacked and MD5 sums checked
checking for prefix by checking for OpenBUGS... /usr/bin/OpenBUGS
checking for gcc... gcc
checking whether the C compiler works... no
configure: error: in `/tmp/RtmpnNLTG1/R.INSTALL488b7635d4c0/BRugs':
configure: error: C compiler cannot create executables
See `config.log' for more details
ERROR: configuration failed for package ‘BRugs’
* removing ‘/home/myuser/lib/R/BRugs’
Warning in install.packages("BRugs") :
  installation of package ‘BRugs’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/Rtmp2ytOWn/downloaded_packages’

这是config.log 的链接。很难判断错误是什么，除了错误以gcc: error: unrecognized option '-V'开头。

我怎样才能绕过这个错误（并安装 BRugs）？

【问题讨论】：

1) 可能在/tmp/RtmpnNLTG1/R.INSTALL488b7635d4c0/BRugs。 2) 您是否按照 Writing R Extensions 的Chapter 1: Creating R packages 中的说明进行操作？
@JoshuaUlrich 1) /tmp/RtmpnNLTG1/ 不存在 2) 我现在正在这样做。
如果您之前没有安装 BRugs，请在您的 shell 中尝试sudo apt-get install build-essential。也许这会安装任何缺少的依赖项。
@halex 我已经有了build-essential 包
@David：我参考的第 3 段引用了 R 安装和管理；请务必阅读该手册的Appendix A。

标签： c r gcc compiler-construction

【解决方案1】：

根据包装说明：

在 Linux 和 Windows 下的 64 位 R 上运行的版本处于“测试版” 状态和效率较低。

看起来configure 正在尝试使用 32 位可执行文件构建包（注意-m32 标志）。最好联系软件包维护者并询问他们如何在 64 位 Ubuntu 下构建 32 位可执行文件。

【讨论】：

谢谢。虽然这并不能解决我的问题，但我们在 cmets 中关于从源代码构建的讨论对我来说是一次很好的学习经历。我很高兴使用 JAGS，但只是想使用 BRugs 来帮助解决我的核心问题，即尝试将 rjags 生成的 mcmc.list 转换为我在 this site 和 stats.se 上的帖子中描述的 rbugs 生成的 coda 对象，尽管每个人都有赏金，但仍未得到答复。