如何使用 qalter 清除 PBS 作业依赖性？

Question

假设我使用qsub -W depend=afterok:JOBID 向集群发送了一个具有依赖关系的作业，如何使用 qalter 命令（使用 PBSpro 调度程序）清除它？我在qalterman page找到了一些信息，但找不到如何清除它，只是如何创建一个新的依赖项。

Answer 1

在一些朋友的帮助下，我得到了答案，显然我必须提交qalter 命令来更改依赖关系，但不是指定新的JOBID，而是省略:JOBID。

示例：

提交一个取决于成功完成之前工作的工作（比如1234）

qsub -q my_queue -l ... -W depend=afterok:1234 file.pbs

新提交的作业将保持暂停状态，直到作业 1234 以 ExitStatus:0 结束。我们可以使用qstat 命令检查新提交的作业的JobId 和状态（它的状态应该是H 表示Hold 并说它的Id 是1235）。 然后，如果我们决定不需要等待第一个命令完成，我们 可以清除依赖：

qalter -W depend=afterok 1235

请注意，我在 afterok 之后省略了冒号和依赖 ID，而 qalter 需要将其正在更改的 JobId 作为其最后一个参数。