在 Python 中通过 '\n' 将字符串拆分为子字符串

Question

我正在用 Python 读取一个长 DNA 数据文件的字符串摘录。某些字符串提取在 .txt 文件中的新行上运行。 Python 使用字符串中的 '\n' 字符打印这些字符串提取。

我的问题是我不知道如何检测位于换行符'\n' 两侧的子字符串。

IE：在下面的代码中，找到了'gca'，但没有找到'taa'。什么是正确的解决方案？

l = 'gcaacacgactta\naccaagctgt'

for i in range(0, len(l), 3):

    if l[i:i+3] == 'taa':
        print(l[i:i+3])

    elif l[i:i+3] == 'gca':
        print((l[i:i+3]))

>>>gca

编辑：我打算搜索 'aac' 而不是 'taa'。无论如何，.replace() 有效。多谢你们！

Answer 1

您每 3 个字符迭代一次，在这种情况下：gcaacacgacttaaccaagctgt。您找不到taa，因为它不在上述元素之一中。要同时拥有gca 和taa，您可以这样做：

l = 'gcaacacgactta\naccaagctgt'
l = l.replace("\n","")

for i in range(len(l)):

    if l[i:i+3] == 'taa':
        print(l[i:i+3])

    elif l[i:i+3] == 'gca':
        print((l[i:i+3]))

输出：

gca
taa

编辑

如果你想要gca 和aac，并且你所有的序列都是三倍的，那么replace 就足够了，这就是输出：

gca
aac

Answer 2

1) 将 '\n' 替换为 ""

2) 将range(0, len(l), 3) 更改为range(len(l)-3)，

l = 'gcaacacgactta\naccaagctgt'

l=l.replace("\n","")

for i in range(len(l)-3):

    if l[i:i+3] == 'aac':
        print(l[i:i+3])

    elif l[i:i+3] == 'gca':
        print((l[i:i+3]))

Answer 3

希望对你有帮助

l = 'gcaacacgactta\nataaccaagctgt'
l=l.replace("\n","")
taa_index=l.find('taa')
while(True):
    print(l[taa_index:taa_index+3])
    p=(l[taa_index+3:]).find('taa')
    if p!=-1:
        taa_index = p+taa_index+3
    else:
        break

同样，你可以为 'gca' 做。现在这适用于多个“taa”