【发布时间】：2016-01-08 19:56:14
【问题描述】：
我正在尝试提取两组重叠栅格的数据（一个是 35 个栅格的堆栈，全部来自同一源，第二个是高程栅格）以获取值的 data.frame（值的平均值) 所有栅格的每个像素。
光栅栈的描述如下：
> stack_pacifico
class : RasterStack
dimensions : 997, 709, 706873, 35 (nrow, ncol, ncell, nlayers)
resolution : 0.008333333, 0.008333333 (x, y)
extent : -81.62083, -75.7125, 0.3458336, 8.654167 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0
names : F101992.v//ts.avg_vis, F101993.v//ts.avg_vis, F101994.v//ts.avg_vis, F121994.v//ts.avg_vis, F121995.v//ts.avg_vis, F121996.v//ts.avg_vis, F121997.v//ts.avg_vis, F121998.v//ts.avg_vis, F121999.v//ts.avg_vis, F141997.v//ts.avg_vis, F141998.v//ts.avg_vis, F141999.v//ts.avg_vis, F142000.v//ts.avg_vis, F142001.v//ts.avg_vis, F142002.v//ts.avg_vis, ...
min values : 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, ...
max values : 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, 63, ...
对于高程栅格：
> elevation_pacifico
class : RasterLayer
dimensions : 997, 709, 706873 (nrow, ncol, ncell)
resolution : 0.008333333, 0.008333333 (x, y)
extent : -81.62083, -75.7125, 0.3458336, 8.654167 (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +datum=WGS84 +ellps=WGS84 +towgs84=0,0,0
data source : in memory
names : COL_msk_alt
values : -16, 5164 (min, max)
这是我第一次使用栅格数据，我想通过 1km2（或更小）的网格提取数据。我知道可以强制两个光栅的分辨率以适应该区域要求，而且两个尺寸都相等，因此每个光栅的像素数是相同的。
我的问题是，我能否仅合并所有栅格（堆栈中的栅格和高程栅格）并在所有像素重叠（或位于同一位置）的情况下提取数据？还是我必须创建一个主 SpatialGrid 或 SpatialPixel 对象，然后将栅格数据提取到这些对象？
提前致谢，
点击此链接可以下载光栅栈中的数据（如果要下载所有的栈，可以使用https://github.com/ivanhigueram/nightlights中的脚本）：
http://www.ngdc.noaa.gov/eog/data/web_data/v4composites/
海拔：
#Download country map and filter by pacific states
colombia_departments <- getData("GADM", download=T, country="CO", level=1)
pacific_littoral <- c(11, 13, 21, 30)
pacific_littoral_map <- colombia_departments[colombia_departments@data$ID_1 %in% pacific_littoral, ]
#Download elevation data and filter it for pacific states
elevation <- getData("alt", co="COL")
elevation_pacifico <- crop(elevation, pacific_littoral_map)
elevation_pacifico <- setExtent(elevation_pacifico, rasters_extent)
【问题讨论】：
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如果两个堆栈的分辨率、范围和坐标系相同，则单元格将完美重叠。
stack_pacifico[]的行将与elevation_pacifico[]的元素对应的单元格相同。 -
感谢您的回答 jbaums。我还有一个疑问。很清楚如何使用
raster::extract和 SpatialPolygon 对象提取栅格数据，例如来自城市或国家的形状文件，但如何提取栅格每个像素的数据。我应该将栅格转换为 SpatialPolygon、Pixels 或 Points 对象，然后extract使用这些对象作为y的数据吗？ -
如果你想要所有单元格的数据，那么下面的任何一个：
as.data.frame(r);r[];values(r)、extract(r, seq_len(ncell(r)))，其中r是Raster*对象，stack_pacifico或elevation_pacifico。对于堆栈，这将为您提供data.frame，每层一列，每个单元格一行，对于单个栅格层，它将为您提供一个矢量。 -
嗯，效果很好，我只将
data.frame选项添加到extract函数中：extract(r, seq_len(ncell(r)), df=T)给我一个data.frame，每个像素（或网格）都有一个ID 变量.我仍然想确定所有栅格中像素的识别。有没有办法获得像素的lan-long？我正在考虑尝试rasterToPoints函数，但我也知道这个过程可能导致错误或丢失数据。有任何想法吗？ （感谢您的广泛帮助！） -
所有单元格的坐标：
coordinates(r)。对于特定单元格，xyFromCell(r, 1:10).
标签： r merge dataframe extract raster