将 PIL 图像转换为 skimage？答案

【问题标题】：Converting a PIL image to skimage?将 PIL 图像转换为 skimage？
【发布时间】：2015-04-28 19:46:21
【问题描述】：

我的代码中加载了一个图像（非常长且不必要，不会在此处发布），我需要使用 skimage 来检测图像中的斑点。但是由于某种原因，我使用的所有图像和尝试都不起作用。

PIL 在上面的代码中修改了图像，使我试图找到的对象只有白色（255、255、255），而所有其他像素都是黑色。这段代码只需要识别这些的位置。我尝试了许多不同的方法来让它工作（将它们转换为 numpy 数组，而不是将它们转换为 numpy 数组等。）

我按照这些说明进行操作：http://scikit-image.org/docs/dev/auto_examples/plot_blob.html 用于基础知识，但这并不是真正的教程，而是一个示例。

我认为 rgb2gray 函数存在问题，因为它只返回 0，而 print(numpy.array(img)) 返回的值介于 0 和 1 之间，这表明信息丢失是在调用 rgb2gray 时。

这是似乎有问题的代码：

img_gray = rgb2gray(numpy.array(img)) # Convert to numpy array for skimage
print(img_gray)
print(numpy.array(img))
img_blobs = blob_doh(img_gray, threshold=0.01, max_sigma=500)
print(img_blobs)

我该如何解决这个问题？

编辑：

以下是每个图像、数组和列表的打印内容：

[[ 0.          0.          0.         ...,  0.          0.          0.        ] #img_gray
 [ 0.          0.00392157  0.01568627 ...,  0.          0.          0.        ]
 [ 0.          0.01176471  0.05882353 ...,  0.          0.          0.        ]
 ..., 
 [ 1.          0.99607843  0.96078431 ...,  0.          0.          0.        ]
 [ 1.          1.          0.98039216 ...,  0.          0.          0.        ]
 [ 1.          1.          0.99215686 ...,  0.          0.          0.        ]]
[[[  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[  0   0   0] #img
  [  1   1   1]
  [  4   4   4]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[  0   0   0] #img
  [  3   3   3]
  [ 15  15  15]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 ..., 
 [[255 255 255] #img
  [254 254 254]
  [245 245 245]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[255 255 255] #img
  [255 255 255]
  [250 250 250]
  ..., 
  [  0   0   0] #img
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]

 [[255 255 255]
  [255 255 255]
  [253 253 253]
  ..., 
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]
  [  0   0   0]]]
[] #img_blobs

【问题讨论】：

你能发帖max(img), min(img), img.dtype吗？
尝试在 rgb2gray() 之前创建 np.array(img) 并打印出你之前和之后的内容（正如 Matthew 建议检查 shape 和 dtype）尝试制作自己的小型测试数组（8 ,8,3) astype(np.uint8) 等，看看是否有任何特定的东西阻止它工作。
max(img)、min(img) 和 img.dtype 在运行时都会引发错误（图像类型不可迭代且 dtype 不是 img 的属性）在 rgb2gray() 之前创建数组什么都没有，但是在帖子的编辑部分中，它显示了（按顺序）img_gray、img、然后是 img_blobs（检测到的 blob）的测试打印输出。
阅读打印输出后，img_gray 似乎包含一些东西，但使用PIL.Image.fromarray(img_gray).show() 时，我只得到黑色图像。

标签： python arrays image numpy pep3118

【解决方案1】：

这会将图像文件（使用 PIL）读入 scimage：

from skimage import io
img = io.imread("./path/to/image.png")

由于您已经读取了图像并想自己进行数据转换，您可以在此处查看插件作者是如何做到的： https://github.com/scikit-image/scikit-image/blob/master/skimage/io/_plugins/pil_plugin.py

【讨论】：