来自 MATLAB 的 Bash 脚本答案

【问题标题】：Bash Script from MATLAB来自 MATLAB 的 Bash 脚本
【发布时间】：2023-04-07 07:09:01
【问题描述】：

我有一个要在 MATLAB 中执行的 bash 脚本。我使用 system() 来执行它。但是，当它执行时，我得到了

docker: command not found

我正在使用脚本中的 docker 命令，并且已将其正确安装在我的计算机中。如果我使用从 MATLAB 中的 system() 调用运行的完全相同的命令从终端运行脚本，则它可以正常工作。在某种程度上，如果我只是从我的 MATLAB 函数（最后一行）中删除 bash 脚本执行调用并运行该函数，然后从终端运行脚本，那么一切正常。

例如这里是一个 MATLAB 函数：

function foo(container_id)
% Copies this file to the root of a docker container given by container_id
system(['./copy_foo.sh ' container_id])
end

这是 bash 脚本

#!/bin/bash

docker cp foo.m $1:/root

从终端运行它

./copy_foo.sh CONTAINER_ID

产生所需的结果。从命令窗口运行 Matlab 函数

foo('CONTAINER_ID')

产量：

docker: command not found

【问题讨论】：

你能分享一个有问题的脚本的最小复制示例吗？
并展示你如何使用system 命令
system 运行的 shell 可能使用不同的 PATH，请参阅“UNIX 提示和限制”here
我根据您的要求编辑了问题。我怎样才能设置路径来完成这项工作？
docker 可执行文件似乎不在您使用 system() 调用时 Matlab 打开的子 shell 中的 $PATH 中。如果您在 bash 脚本中明确设置相同的 PATH（在您的 bash 终端中）怎么办？

标签： bash matlab docker

【解决方案1】：

MATLAB 在启动时会更改环境变量。特别是，LD_LIBRARY_PATH 和 PATH 受到影响。有两种解决方案：

使用docker 可执行文件的显式路径。您的 Bash 脚本将包含 /path/to/docker cp foo.m $1:/root 行。
确保在运行脚本之前正确初始化环境。您的 MATLAB 脚本将包含 system(['bash --login -c ./copy_foo.sh ' container_id]) 行（或类似的东西，我还没有测试过......）。

【讨论】：