我有一些数据，其中一个变量有一些缺失值，我希望能够创建（随机）预测这些可能是什么。这是我的第一个想法：
# miss indicates where the observations with missing response are
library(MASS)
model <- glm.nb(data[-miss,4] ~ ., data=data[-miss,-4])
predict(model, newdata=data[miss,-4])
但是，如果我重复最后一行，它会一遍又一遍地给出相同的答案 - 它似乎给出了给定数据和模型的响应的预测平均值。我想要一个包含方差的随机预测，即在给定模型下使用此类预测变量从观察响应的分布中随机抽取。
它可能与 pred.var 参数有关，但我不确定如何使用它。
【问题讨论】：
假设我们有这样的数据：
set.seed(101)
dd <- data.frame(x=(1:20)*0.1)
dd$y <- rnbinom(20,mu=exp(dd$x),size=1)
## make some missing values
miss <- c(2,3,5)
dd$y[miss] <- NA
现在拟合一个模型：
m1 <- MASS::glm.nb(y~x,dd,na.action=na.exclude)
现在使用来自该模型的预测来获得预期的 mean 值，并使用rnbinom 来生成随机值...
p <- predict(m1,newdata=dd,type="response")
randvals <- rnbinom(length(p),mu=p,size=m1$theta)
（这会为每个元素提供随机值，而不仅仅是缺少的元素，但显然你可以只选择你想要的那些......）如果simulate 方法这样做会很好，但它并不完全足够灵活...
【讨论】：