从 R 中具有多个文件夹的压缩临时文件中读取 csv 文件答案

【问题标题】：read csv file from zipped temp file with multiple folders in R从 R 中具有多个文件夹的压缩临时文件中读取 csv 文件
【发布时间】：2012-05-24 01:04:09
【问题描述】：

我正在尝试读取包含在我从网络上提取的文件中的 csv 文件。问题是压缩文件有多个级联文件夹。我必须为几个不同的单位这样做，所以我正在执行一个循环。循环没有问题，文件名正确，我可以下载文件。但是我收到一条错误消息（我认为是因为 R 找不到我要求它找到的确切文件）。错误是：

Error in open.connection(file, "rt") : cannot open the connection
In addition: Warning message:
In open.connection(file, "rt") :
  cannot locate file 'XXXX.csv' in zip file 'c:\yyy\temp\bla\'


download.file(paste("http://web.com_",units[i],"_",places[j],".zip",
                     sep=""),
                     temp,
                     cacheOK = F )
data <- read.csv2(unz(temp,
                   paste("name_",units[i],"_",places[j],".csv",
                   sep="")),
                   header=F,
                   skip=1)
unlink(temp)
fili<-rbind(X,
            data)

}

如何让 R 找到我想要的文件？

【问题讨论】：

我从未在 R 中处理过压缩数据，但您可以在压缩文件中将 list.files() 与 full.names=TRUE 和 recursive=TRUE 组合起来以找到正确的文件吗？获得目录列表后，您可以grep 找到正确 csv 文件的完整路径。也看到这个问题：stackoverflow.com/questions/8986818/…

标签： r csv unzip

【解决方案1】：

你有正确的方法，但是（正如警告告诉你的）错误的文件名。

在开始尝试读取其内容之前，请仔细检查 zip 文件是否存在。

if(file.exists(temp))
{
  read.csv2(unz(...))
} else
{
  stop("ZIP file has not been downloaded to the place you expected.")
}

浏览下载的文件（您可能希望先将其解压缩）以确保您在正确的位置查找 CSV 内容也是一个好主意。

【讨论】：

【解决方案2】：

看起来您要阅读的文件位于目录中。在这种情况下，您的读数应更改如下：

data <- read.csv2(unz(temp,
                   paste("**dirname**/name_",units[i],"_",places[j],".csv",
                   sep="")),
                   header=F,
                   skip=1)

【讨论】：