在输出中突出显示 Sweave 语法答案

【问题标题】：Sweave syntax highlighting in output在输出中突出显示 Sweave 语法
【发布时间】：2011-01-26 17:55:18
【问题描述】：

有没有人设法在 Sweave 文档的输出中使用颜色语法突出显示？我已经能够通过在Sweave.sty 文件中添加框等来自定义输出样式，如下所示：

\DefineVerbatimEnvironment{Sinput}{Verbatim}{fontseries=bc,frame=single}
\DefineVerbatimEnvironment{Soutput}{Verbatim}{frame=leftline}
\DefineVerbatimEnvironment{Scode}{Verbatim}{fontseries=bc}

我可以使用minted 包来对文档中的逐字代码块进行语法高亮显示，如下所示：

\begin{minted}{perl}
use Foo::Bar;
...
\end{minted}

但我不确定如何将两者结合起来用于 R 输入部分。我尝试了以下方法：

\DefineVerbatimEnvironment{Sinput}{minted}{r}
\DefineVerbatimEnvironment{Scode}{minted}{r}

有什么建议吗？

【问题讨论】：

标签： r syntax-highlighting sweave

【解决方案1】：

是的，看看Rcpp 的一些小插曲，例如（仅选择一个）Rcpp-FAQ pdf。

我们使用 Romain 的 highlight，它本身可以移植到 Andre Simon 的 hightlight 二进制文件。它使一切都更加复杂——用于小插图等 pp 的 Makefiles——但我们从 R 和 C/C++ 代码中获得了丰富多彩的输出。这值得。

【讨论】：

【解决方案2】：

我有一个对我有用的解决方案，但我还没有在任何其他系统上尝试过，所以可能无法为您开箱即用。我在https://gist.github.com/797478 发布了一些代码，这是一组修改后的 Rweave 驱动程序函数，它们使用铸造块而不是逐字块。

要使用此驱动程序，只需在使用 driver=RweaveLatexMinted() 选项调用 Sweave 函数时指定它即可。

【讨论】：

【解决方案3】：

从@daroczig 的建议开始，这就是我最终解决它的方法。

\usepackage{minted}

\renewenvironment{Sinput}{\minted[frame=single]{r}}{\endminted}
\DefineVerbatimEnvironment{Soutput}{Verbatim}{frame=leftline}
\DefineVerbatimEnvironment{Scode}{Verbatim}{}

当我这样做时，我需要让缓存工作，因为我使用的是大型数据集，而一个块大约需要 3 分钟才能完成。所以我写了这个zsh shell 函数来处理带有缓存的.Rnw 文件：

function sweaveCache() {
    Rscript -e "library(cacheSweave); setCacheDir(getwd()); Sweave('$1.Rnw', driver = cacheSweaveDriver)" &&
    pdflatex --shell-escape $1.tex &&
    open $1.pdf
}

现在我只需执行sweaveCache myFile 并在预览中打开结果（在 OS X 上）。

【讨论】：

顺便说一句，minted 需要 --shell-escape 东西，因为它在 Python 中进行语法高亮显示。
在 r-studio 中，shell 转义是通过工具 - 全局选项 - Sweave - 启用 shell 转义命令完成的。 Minted 还需要 python 包“pygments”。在 Linux 上，通过“sudo pip2 install Pygments”安装

【解决方案4】：

tex.StackExchange 上的This topic 可能对您来说很有趣，因为它建议在 R 中加载 SweaveListingUtils package 以便于解决。

【讨论】：

谢谢。我似乎无法让SweaveListingUtils 工作，但我会试试\renewenvironment 的东西。
@Ken Williams：你能具体说明这个包有什么问题吗？我希望它可以作为一个简单易用的解决方案对您有用。如果错误仍然存在，祝你好运！