停止循环子 .Rnw 文档中的 knitr 序言答案

【问题标题】：Stop knitr preamble in looped child .Rnw documents停止循环子 .Rnw 文档中的 knitr 序言
【发布时间】：2013-12-13 13:52:49
【问题描述】：

我正在循环一个子 .Rnw 文件，这样我就可以用不同的物种重复情节。不幸的是，knitr 的序言（我认为）在每个循环的开头都会重复，因此 .pdf 将无法编译。如果我手动删除.tex 文件中重复的序言，一切都很好。我有一种感觉，我错过了父母和孩子之间的一些联系，但找不到确切的位置。我正在使用 R-studio 和下面列出的文件。

main.Rnw:

\documentclass{article}
\begin{document}

<<>>=
some R stuff
@

<<runall, include =FALSE>>=
out<-c()
for(species in c('RH', "GU", "RA", "KI")){
out<- c(out, knit_child('spsummary.Rnw')
}
@

\Sexpr{paste(out, collapse='n')}
\end{document}

子文档 (spsummary.Rnw) 在每个物种上循环：

<<>>=
set_parent("main.Rnw")
@

<<>>=
more R stuff
@

\begin{table}
...
\end{table}

\clearpage
\newpage

【问题讨论】：

这对我来说很好。

标签： r loops parent-child knitr sweave

【解决方案1】：

您可以从子文档中删除set_parent，因为您不想单独编译子文档。请参阅help 中的这句话：

子文档通常不完整——缺少的部分是 LaTeX 序言以及\begin{document} 和\end{document}。有时我们可能想要编译这样的子文档，就好像它们是完整的一样乳胶文件。我们唯一需要做的就是提取一个来自父文档的适当序言并将其添加到该子文档文档。函数set_parent() 启用此功能； [...] 然后子文档的行为就像它有一个序言一样

【讨论】：

感谢您的建议罗洛。我已尝试删除此声明，但我仍然在 .tex 文件中为每个物种（每个重复的孩子）获得序言。重复的序言是 knitr 的所有文本颜色和错误颜色（不是我指定的任何内容）。

【解决方案2】：

我终于回答了我自己的问题。

这是缺少反斜杠的简单案例。

父文档（主）的最后一行应为：

\Sexpr{paste(out, collapse='\n')}

在'n'之前有一个反斜杠

【讨论】：