在 Shiny 中，Python 虚拟环境 PERMISSION DENIED（错误 126）答案

【问题标题】：In Shiny, Python Virtual environment PERMISSION DENIED (Error 126)在 Shiny 中，Python 虚拟环境 PERMISSION DENIED（错误 126）
【发布时间】：2023-11-15 09:13:01
【问题描述】：

我们正在通过 R Shiny 构建用户界面 APP（通过机器学习模型预测连续变量）。由于我们在 Python3 sklearn 模块中构建了机器学习模型，我们希望我们可以在 R Shiny 中编写 Python 代码来调用该模型和相应的函数。

我们使用 R-package "reticulate" 来创建虚拟 python 环境，它可以保存 python 包，并通过它我们可以调用 python3 函数。

我们使用以下代码行创建了虚拟环境（R包“reticulate”中的函数）

use_virtualenv("env", required = TRUE)

我们确实有以下目录“env/bin”，其中有python和python3要执行。

Shiny APP 在本地完美运行。但是，当我们尝试发布时，它给出了the following error (please see picture)（APP成功部署后，在shinyapps.io上，它说APP正在运行）。

问题是“错误126”，它拒绝了我们的APP访问虚拟环境的权限。这个问题在 * 上没有以前的（类似）案例，因此我们花了很长时间调试（问题未解决）。

如果有人知道如何解决这个问题，您可以在下面标记您的解决方案提示吗？（我们希望您的解决方案不会修改我们的基本布局，即“在 Shiny 中调用 python-made 模型并通过 Shiny 发布”）非常感谢您为我们提供的帮助！

非常感谢！

【问题讨论】：

标签： python r shiny permission-denied reticulate

【解决方案1】：

您能否分享实际调用 python 脚本的代码？它是您从 Rshiny 调用的 python 模块函数吗？ python模块/函数做什么并返回？我在 Shiny 中使用了 reticulate 来调用 Python 脚本，它工作正常。不需要设置环境。只需提供 python 脚本的源代码并像调用任何其他 R 函数一样调用它。

【讨论】：

【解决方案2】：

如果您尝试部署到 shinyapps.io，您可能需要设置 RETICULATE_PYTHON 环境变量，以便 reticulate 在运行您的应用时使用正确的 Python 版本：

VIRTUALENV_NAME = 'env'
Sys.setenv(RETICULATE_PYTHON = paste0('/home/shiny/.virtualenvs/', 
                               VIRTUALENV_NAME, 
                               '/bin/python'))

Full example here 演示了一种配置 Shiny + reticulate 应用程序的方法，以便它可以轻松地在本地和 shinyapps.io 上运行。

【讨论】：