BatchJobs results 给出函数 result * -1 + job#?答案

【问题标题】：BatchJobs results gives the function result * -1 + job#?BatchJobs results 给出函数 result * -1 + job#?
【发布时间】：2015-11-07 21:58:09
【问题描述】：

我正在运行一个使用 BatchJobs 的最小示例，结果与预期不符。我正在使用global_config settings，调试=TRUE。我在我的 HPC 服务器上的 R 中运行以下代码：

library(BatchJobs)
reg <- makeRegistry(id = "batchtest")

batchMap(reg, identity, 1)
submitJobs(reg)
showStatus(reg)

load("batchtest-files/jobs/01/1-result.RData")
1-result
[1] 0

如果我运行 batchMap(reg, identity, 2) 结果是 -1，而使用 batchMap(reg, identity, 3) 结果是 -2。任何想法为什么会发生这种情况？标识函数应该只返回参数（因此对于上面的代码，它应该是 1）。我发现其他功能也有同样的问题。例如，如果我将 mean(rnorm(100, mean=100)) 用于发送到 batchMap 的函数，我最终会得到大约 -99 的结果。如果我在多个节点上运行它，每个节点的结果大约是 -100 + 节点数（所以第 5 个节点的结果大约是 -95）。

【问题讨论】：

标签： r parallel-processing hpc lsf

【解决方案1】：

试试ls()。 load 命令的正确结果可能存储在变量result 中。当您计算1-result 时，您将得到与您描述的完全相同的结果。

【讨论】：

哦，就是这样！我在想象变量名将与文件名相同，尽管在 R 中的变量名中当然不能有 - 。我想我已经盯着这个太久了。非常感谢您的帮助！