识别 R 中的重叠数值范围答案

【问题标题】：Identifying Overlapping Numeric Ranges in R识别 R 中的重叠数值范围
【发布时间】：2021-07-08 01:57:58
【问题描述】：

我想创建一个由相互重叠的 ID 组成的利基网络。

df <- 
  data.frame(
    id = 1:5, 
    start_year = c(2010, 2010, 2011, 2013, 2014), 
    end_year = c(2014, 2012, 2018, 2015, 2020))

  id start_year end_year
1  1       2010     2014
2  2       2010     2012
3  3       2011     2018
4  4       2013     2015
5  5       2014     2020

需要成对比较，这是我想不通的部分。对于任何 x y 比较，它看起来像这样：

1 & 2 overlapped 3 years (2010, 2011, 2012)
1 & 3 overlapped 4 years (2011, 2012, 2013, 2014)
1 & 4 overlapped 2 years (2013, 2014)
etc

对于上述 3 个示例，我所关心的只是让它一式三份：

1, 2, 3
1, 3, 4
1, 4, 2
etc

TIA

【问题讨论】：

标签： r graph-theory pairwise

【解决方案1】：

您可以使用combn来获取行的不同组合并应用以获取重叠

result <- as.data.frame(t(apply(combn(nrow(df), 2), 2, 
                            function(x) c(id_1 = x[1],
                                          id_2 = x[2],
                                          overlap = sum(df[x[1],2]:df[x[1],3] %in% df[x[2],2]:df[x[2],3])))))

result

   id_1 id_2 overlap
1     1    2       3
2     1    3       4
3     1    4       2
4     1    5       1
5     2    3       2
6     2    4       0
7     2    5       0
8     3    4       3
9     3    5       5
10    4    5       2

【讨论】：