去除热图 colkey 中的白线答案

【问题标题】：Removing white lines in colkey of a heatmap去除热图 colkey 中的白线
【发布时间】：2017-08-17 08:26:18
【问题描述】：

我正在尝试创建热图，但颜色键有一些白线。

问题#1：如何去除这些白线？范围应为 -100 到 100。颜色键中只有“0”应为白色。

问题#2：如何删除列标签中的“X”？

这是我的脚本：

library(gplots)
dat <- read.csv("Baguio.csv", header=TRUE)
mat_data<-data.matrix(dat)

my_palette <- colorRampPalette(c("blue","white","red"))(200)
breaks=c(seq(-100,-1,length=100),0,seq(1,100,length=100))

png("heatmap.png",    # create PNG for the heat map
 width = 5*300,        # 5 x 300 pixels
 height = 5*300,
 res = 300,            # 300 pixels per inch
 pointsize = 8)        # smaller font size

heatmap.2(mat_data,
 main = "test", # heat map title
 notecol="black",      # change font color of cell labels to black
 density.info="none",  # turns off density plot inside color legend
 trace="none",         # turns off trace lines inside the heat map
 margins =c(5,5),     # widens margins around plot
 col=my_palette,
 breaks=breaks,
 dendrogram="none",
 symkey=F, xlab="Year", ylab="Date",
 Colv="NA",Rowv="NA")            # turn off column clustering
dev.off()               # close the PNG device

这是数据的链接： Data

我将不胜感激。

【问题讨论】：

请使用dput(dat) 并在帖子本身中包含structure 对象，而不是外部链接

标签： r heatmap gplots

【解决方案1】：

问题 1：您可以使用 tidyverse 包中的 read_csv。它可以使用数字作为名称。

问题 2：我复制了您的代码，但我的图形没有白线。也许你可以提高分辨率？

【讨论】：