gplots 包中的多个 RowSideColor 列 heatmap.2

Question

我希望能够将两个 RowSideColor 条与 R 包图中的 heatmap.2 函数一起使用，但我不知道该怎么做。我之前在堆栈溢出时看到过这个问题，虽然这个问题得到了答复，但答复并没有解决这个问题。将因子添加到输入数据矩阵将不起作用，因为它会影响层次聚类的结果。如果有必要，我愿意使用其他类似热图的功能来实现我的目标。

谢谢， 布拉德

Answer 1

我以前就想这样做，并且总是制作两个热图，然后将一个 RowSideColors 条从一个热图复制并粘贴到另一个热图中。我只是做了一些搜索，发现可以做到这一点的 heatmap.plus 包：

# install.packages("heatmap.plus") #install package
require("heatmap.plus")

data(cars) # using cars data as example

# create a matrix of colors for RowSideColors
myCols = cbind(rep(c("yellow", "blue"), 25), rep(c("red", "green"), 25))

heatmap.plus(data.matrix(cars), RowSideColors=myCols)

这个包中的RowSideColors 参数可以接受一个颜色矩阵来绘制多个行侧颜色。