如何将 sweave 生成的图形复制到子文件夹？答案

【问题标题】：How to make sweave copy generated graphics to a subfolder?如何将 sweave 生成的图形复制到子文件夹？
【发布时间】：2011-01-12 22:09:01
【问题描述】：

我很想在我的 Sweave 报告创建的所有 graphics.pdf 上使用一些基于 shell 脚本的 pdfcrop。因此，如果所有图形都存储到一个子文件夹而不是被丢弃在所有乳胶文件（如 .aux .log 文件（等等）所在的位置），我会很好。如果我只需要对特定目录中的所有文件使用裁剪脚本，那就容易多了。

这是我的 Sweave 块：

\begin{figure}[htbp]
  \begin{center}
  <<fig=true,echo=false>>=
  print(mygraph)
  @
\caption{my graph}
\end{center}
\end{figure}

如果我运行 sweave 代码 mygraph.pdf 存储在与 report.tex 文件本身相同的目录中。

有没有办法将此文件存储在现有的子文件夹中，例如 /graphics ？

【问题讨论】：

标签： r sweave

【解决方案1】：

插入：

\SweaveOpts{prefix.string=foo/bar}

进入你的 Sweave 源文件，最好在序言的顶部。上面一行来自Sweave FAQ，表示创建的图形将存储在（Sweave源所在目录的）子目录foo中，每个图像文件名都以bar开头。 Sweave FAQ.

中讨论了这一点以及更多内容

【讨论】：

acc。虽然我觉得这次我更快;）
@ran2 你是，大约 10 秒 ;-) 选择你自己的答案作为接受的答案并没有错 - 甚至还有一个徽章（“自学者”IIRC）。如果你想去接受你的回答，我不会觉得辛苦。最重要的是，一个有效的答案会被接受，这样以后遇到这个 Q 的任何人都知道它已成功回答。
Afaik 如果您自己的答案获得至少 3 次赞成票，则会授予自学者徽章。所以尽管接受了你的，我还是得到了一个；）

【解决方案2】：

好的，RTFM，ran2。

方法如下：

 \SweaveOpts{prefix.string=graphics/report}

另请参阅：the manual。

graphics 是目录，report 是您可能想要使用的子字符串。至少你会在谷歌上找到更好的:)

编辑：

为了完整起见，我将在此处添加几行 shell 脚本：

#!/bin/sh
R CMD Sweave report.Rnw   
for file in `ls graphics`;
do pdfcrop "$file" graphics/"$file"
done
pdflatex report.tex
open report.pdf

也许你们中的一些人想使用 $1 作为目录参数。

【讨论】：