rmarkdown::render() 在循环中 - 无法分配大小向量

Question

我有一堆目录，其中包含要编译成 HTML 的 Rmd 文件。对rmarkdown::render 的每次调用都包含大量params 列表。当我单独渲染 Rmd 文件时，一切正常。

但是，当我执行一个循环遍历目录并构建 HTML 文件的函数时，它在完成九个之后崩溃（它不是导致问题的特定 Rmd，无论顺序如何，它都会在 9 日崩溃）。

错误回溯的相关部分是：

Error: cannot allocate vector of size 38.4 Gb

8. knitr::knit_meta_add(old_knit_meta, attr(old_knit_meta, "knit_meta_id")) 

7. rmarkdown::render(input = RMDfile, output_file = RMDfileout, 
        output_format = output, output_dir = dir, param = params, 
        quiet = quiet)

问题似乎是由rmarkdown::render中的这一行引起的：

 on.exit({
    knit_meta_reset()
    if (length(old_knit_meta)) {
      knitr::knit_meta_add(old_knit_meta, attr(old_knit_meta, 
                                               "knit_meta_id"))
    }
  }, add = TRUE)

在我看来，之前调用的params 被保存在元数据中，并且在函数中调用rmarkdown::render 9 次后变得太大。

rmarkdown::knitr 有一个 knit_meta 参数，但帮助文档说 “（供专家使用）由 knitr 生成的元数据”，我不是 knitr 专家。

Rmd 文件彼此完全独立。有没有办法将每次调用的 knitr 元数据重置为 rmarkdown::render？

我希望有人可以为此提供快速修复或解决方法。如果没有，我将开发一个示例来重现该问题。

Answer 1

在rmarkdown::render 代码中挖掘了一段时间后，我找到了解决方案。

在rmarkdown::render(input=file, etc) 之前添加knitr::knit_meta(class=NULL, clean = TRUE) 似乎可以解决问题..