错误：pandoc 文档转换失败，错误 61

Question

我在数据帧上运行create_report()，而 R 正在返回一条错误消息。

我尝试卸载rmarkdown 并在以管理员身份打开 R 后重新安装。我还尝试了 Ron 的评论，建议执行以下操作：Rmarkdown HTML Template produces pandoc error 61

file.edit("~/.Renviron") 并在那里设置一个像这样的本地路径R_USER="C:/Users/my_name"

我运行了这个：

dbconnection <- odbcDriverConnect("Driver=SQL Server;Server=******;Database=*******;trusted_connection=yes")
initdata <- sqlQuery(dbconnection,paste("SELECT * FROM OPENQUERY(****,'SELECT fid****, fid****, fid**** FROM *************') WHERE fid**** = 'XXXXXXX' AND fid**** = 'XXXXXX';"))
odbcClose(dbconnection)

summary(initdata)
glimpse(initdata)
vis_miss(initdata)
vis_dat(initdata)
create_report(initdata)

RStudio 会返回这个：

Could not fetch http://?/UNC/******/FolderRedirection/user.name/Documents/R/win-library/3.6/rmarkdown/rmd/h/default.html
HttpExceptionRequest Request {
  host                 = ""
  port                 = 80
  secure               = False
  requestHeaders       = []
  path                 = "/"
  queryString          = "?/UNC/******/FolderRedirection/user.name/Documents/R/win-library/3.6/rmarkdown/rmd/h/default.html"
  method               = "GET"
  proxy                = Nothing
  rawBody              = False
  redirectCount        = 10
  responseTimeout      = ResponseTimeoutDefault
  requestVersion       = HTTP/1.1
}
 (InvalidDestinationHost "")
Quitting from lines 27-36 (test.Rmd) 
Error: pandoc document conversion failed with error 61
Execution halted

我希望能够在 HTML 文档中生成图表，如下页底部所述：

https://www.littlemissdata.com/blog/simple-eda

Answer 1

这个问题（至少在我的情况下）源于使用的降价库是一个网络文件夹（在你的情况下为“?/UNC/******/FolderRedirection/user.name/Documents/R /win-library/3.6/rmarkdown/rmd/h/default.html")。 R 无法访问此文件夹，因为缺少权限。

您必须将默认库更改为您拥有完全权限的位置。例如“C:/Program Files/R/R-3.6.2/library”。

在 RStudio 中，单击 Tools>Install Packages.. 在“Install to library”下，您可以看到默认选项（在您的情况下，它应该是“?/UNC/******/FolderRedirection/user.name /Documents/R/win-library/3.6/rmarkdown/rmd/h/default.html")。这里的第二个选项应该是“C:/Program Files/R/R-3.6.2/library”。

要更改此顺序，即将“C:/Program Files/R/R-3.6.2/library”文件夹设为默认文件夹，您必须使用以下代码（在新的 R 文件中执行代码) :

bothPaths <- .libPaths()   # extract both paths
bothPaths <- c(bothPaths [2], bothPaths [1])  # change order
.libPaths(bothPaths )  # modify the order

之后，您可能需要再次安装 markdown 包。这次直接安装到“C:/Program Files/R/R-3.6.2/library”文件夹下。

现在，编织应该可以工作了，因为 R 将直接使用您拥有完整权限的文件夹中的包。