如何使用 R 跳过我要导入的数据文件中的注释行答案

【问题标题】：How to skip comments line in data file I want to import, with R如何使用 R 跳过我要导入的数据文件中的注释行
【发布时间】：2013-07-05 09:22:09
【问题描述】：

我有很多字符串文件 (.str)，我想在 R 中导入它们（循环文件）。问题是第一行既不是列名也不是矩阵的开头。它是注释行。最后一行同上。在这两行之间，站起来我要导入的矩阵.. 我该怎么做？

谢谢

【问题讨论】：

欢迎来到 SO。请阅读本文以了解如何创建reproducible example。例如，在这种情况下，您应该添加文本的某些部分，然后您尝试了什么。
它们之前是否有任何类型的评论字符？
阅读?read.table。参数skip、nrow 和comment.char 可能与您相关。
如果文件的结构不同，您可以随时使用readLines 读入，然后使用正则表达式函数删除不需要的行，然后再转换为您想要的数据结构。
@user2551551 但是如果 first 行是您要跳过的那一行，只需在 read.table 中使用 skip = 1 即可跳过第一行行并照常进行，例如read.table( "myfile.txt" , skip = 1 , header = TRUE )

标签： r matrix import line skip

【解决方案1】：

如果您想跳过文件中的前和行，可以按如下方式进行。使用readLines将文件读入字符向量，然后传递给read.csv。

strs <- readLines("filename.csv")
dat <- read.csv(text=strs,             # read from an R object rather than a file
                skip=1,                # skip the first line
                nrows=length(strs) - 3 # skip the last line
                )

- 3 是因为数据的行数比文件中的文本行数少 3：开头跳过了 1 行，列标题跳过了 1 行，结尾跳过了 1 行。当然，您也可以忽略 nrows 参数，并在导入后从数据框中删除无意义的行。

【讨论】：

【解决方案2】：

您可以将 cmets 放在数据文件中的任何位置，就像将 cmets 放入 R 脚本一样。例如，如果我有这样的data.txt：

# comment 1
str1
str2
# comment 2
str3
# comment 3
str4
str5# comment 4
str6
str7
# comment 5

那么你不需要做任何事情来跳过 cmets：

> x<-read.table("data.txt", header=FALSE)
> x
    V1
1 str1
2 str2
3 str3
4 str4
5 str5
6 str6
7 str7
>

请注意，comment 4 不会被读取。您可以使用comment.char 选项更改评论字符#。

【讨论】：

【解决方案3】：

如果将 Hong Ooi 提供的 readLines 方法与负索引结合使用，则可以跳过文件中的任意行。这是一个示例，它跳过了文件中的第 2-5 行，该文件具有标题但有许多注释/元信息行：

lines <- readLines('myfile.txt')
mytable <- read.table(text = lines[-c(2:5)], sep = '\t', header = T)

【讨论】：

这不会跳过这些行。它读取所有行，然后删除其中一些行。如果文件很大，这是一个不好的方法。