从 `parallel` 包中的非基本 R 包调用函数，而不在函数中将它们库化

Question

假设我正在尝试运行以下代码

library(gregmisc)
library(parallel)
myfunction <- function(x){
  combinations(10, x, 1:10)
}
cl <- makeCluster(getOption("cl.cores", 2))
parLapply(cl, 3, myfunction)

我收到了错误

#Error in checkForRemoteErrors(val) : 
#one node produced an error: could not find function "combinations"

所以，如果我在函数中库“gregmisc”包，它将起作用

myfunction <- function(x){
  library(gregmisc)
  combinations(10, x, 1:10)
}
cl <- makeCluster(getOption("cl.cores", 2))
parLapply(cl, 3, myfunction)

问题是，我怎样才能避免函数内的库包？

我看到在here 和here 中已经针对“雪”和“降雪”提出了类似的问题

但我无法让它为“并行”包工作

我试过了（没有成功）

library(snow)
library(snowfall)
sfExport(list=list("combinations"))
sfLibrary(gregmisc)
clusterEvalQ(cl, library(gregmisc))

Answer 1

我在 gregmisc 中没有看到任何 combinations 函数。这可能是您的实际问题吗？

使用clusterEvalQ() 在每个节点上加载包应该可以工作，并且一直对我有用。 以下代码几乎是从vignette("parallel") 的第 8 页逐字提取的：

require(parallel)
cl <- makeCluster(4)
junk <- clusterEvalQ(cl, library(boot)) ## Discard result

Answer 2

各个节点的环境不一样。尝试明确指定包：

myfunction <- function(x){
  gregmisc::combinations(10, x, 1:10)
}