绘制基因矩阵

【问题标题】：Plot a gene matrix绘制基因矩阵
【发布时间】：2023-03-04 00:13:02
【问题描述】：

我有一个包含基因计数和许多样本的 .csv 文件（如下所示）。我希望能够按样本绘制总基因计数图。文件格式如下：

       Sample
Gene    1        2
gene1   272.43    911.83
gene2   212.29    151.55
gene3   39.41      22.17

任何想法如何做到这一点？

【问题讨论】：

标签： r matrix plot bioinformatics

【解决方案1】：

不确定您要的是什么，但也许这就是您的想法：

library('ggplot2')
Sample <- melt(data.frame(Gene=c('gene1', 'gene2', 'gene3'), sample1=c(272.43,212.29,39.41), sample2=c(911.83,151.55,22.17)))
p <- ggplot(data=Sample, aes(x=variable, y=value)) + geom_line(aes(colour=Gene, group=Gene))
p

给你这个：

【讨论】：