在忽略 NA 值的同时计算 cumsum()

Question

考虑以下命名向量x。

( x <- setNames(c(1, 2, 0, NA, 4, NA, NA, 6), letters[1:8]) )
# a  b  c  d  e  f  g  h 
# 1  2  0 NA  4 NA NA  6 

我想计算x 的累积总和，同时忽略NA 值。许多 R 函数都有一个参数 na.rm，它会在计算之前删除 NA 元素。 cumsum() 不是其中之一，这使得这个操作有点棘手。

我可以这样做。

y <- setNames(numeric(length(x)), names(x))
z <- cumsum(na.omit(x))
y[names(y) %in% names(z)] <- z
y[!names(y) %in% names(z)] <- x[is.na(x)]
y
# a  b  c  d  e  f  g  h 
# 1  3  3 NA  7 NA NA 13 

但这似乎太过分了，并且做了很多新的任务/副本。我相信有更好的方法。

有什么更好的方法可以在有效忽略NA值的情况下返回累积和？

Answer 1

你可以在一行中做到这一点：

cumsum(ifelse(is.na(x), 0, x)) + x*0
#  a  b  c  d  e  f  g  h 
#  1  3  3 NA  7 NA NA 13

或者，类似地：

library(dplyr)
cumsum(coalesce(x, 0)) + x*0
#  a  b  c  d  e  f  g  h 
#  1  3  3 NA  7 NA NA 13 

Answer 2

你想要这样的东西吗：

x2 <- x
x2[!is.na(x)] <- cumsum(x2[!is.na(x)])

x2

[编辑] 或者，正如上面评论所建议的，您可以将 NA 更改为 0 -

miss <- is.na(x)
x[miss] <- 0
cs <- cumsum(x)
cs[miss] <- NA
# cs is the requested cumsum

Answer 3

这是一个老问题，但tidyr 提供了一个新的解决方案。 基于将NA 替换为零的想法。

require(tidyr)

cumsum(replace_na(x, 0))

 a  b  c  d  e  f  g  h 
 1  3  3  3  7  7  7 13 

Answer 4

这是我从这个问题的答案中得出的一个函数。以为我会分享它，因为到目前为止它似乎运作良好。它计算x 的累积FUNC，同时忽略NA。 FUNC 可以是 sum()、prod()、min() 或 max() 中的任何一个，x 是一个数值向量。

cumSkipNA <- function(x, FUNC)
{
    d <- deparse(substitute(FUNC))
    funs <- c("max", "min", "prod", "sum")
    stopifnot(is.vector(x), is.numeric(x), d %in% funs)
    FUNC <- match.fun(paste0("cum", d))
    x[!is.na(x)] <- FUNC(x[!is.na(x)])
    x
}

set.seed(1)
x <- sample(15, 10, TRUE)
x[c(2,7,5)] <- NA
x
# [1]  4 NA  9 14 NA 14 NA 10 10  1
cumSkipNA(x, sum)
# [1]  4 NA 13 27 NA 41 NA 51 61 62
cumSkipNA(x, prod)
# [1]      4     NA     36    504     NA   7056     NA
# [8]  70560 705600 705600
cumSkipNA(x, min)
# [1]  4 NA  4  4 NA  4 NA  4  4  1
cumSkipNA(x, max)
# [1]  4 NA  9 14 NA 14 NA 14 14 14 

绝对没有什么新鲜事，但可能对某人有用。