ggplot中网格的热图/密度图答案

【问题标题】：Heatmap/density plot from a grid in ggplotggplot中网格的热图/密度图
【发布时间】：2021-03-24 20:31:35
【问题描述】：

我有一个网格格式的 CSV 文件。

Link to the raw csv file on github

我想使用 ggplot 来绘制它，这样它就会看起来像这个图。

颜色代表单元格中的值。（提供的csv有其他值）

如果不使用 x 和 y 美学，我无法让它工作。也许它可以通过使用行名和列名来修复，但现在第一行和第一列被用作列名和行名。也需要找到一些东西来改变它。

我觉得我快疯了。想要使用 geom_bin2d() 甚至 stat_density_2d() 但无法工作。

【问题讨论】：

如果您包含一个简单的reproducible example，其中包含可用于测试和验证可能解决方案的示例输入和所需输出，则更容易为您提供帮助。在问题本身中包含示例数据，而不是链接到外部网站并显示您尝试过的代码。如果您的数据已经分箱，请改用 geom_tile() 之类的内容。

标签： r ggplot2

【解决方案1】：

也许你可以试着把它融化然后geom_raster():

library(ggplot2)
library(reshape2)

x = read.csv("https://raw.githubusercontent.com/Friends-of-Tracking-Data-FoTD/LaurieOnTracking/master/EPV_grid.csv",header=FALSE)

ggplot(melt(as.matrix(t(x))), aes(Var1,Var2, fill=value)) + 
geom_raster() + 
scale_fill_viridis_c(direction=-1) + 
theme_minimal()

或者：

ggplot(melt(as.matrix(t(x))), aes(Var1,Var2, fill=value)) + 
geom_tile() + 
scale_fill_viridis_c(direction=-1) + 
theme_minimal()

【讨论】：

效果很好，谢谢！没有 as.matrix() 的 melt() 所以出了问题