如何连接 kubeflow 管道组件

Question

我想通过传递任何类型的数据来建立组件之间的管道连接，只是为了让它看起来像带有箭头的流程图一样有组织。现在就像下面

无论 docker 容器是否生成输出，我都希望在组件之间传递一些示例数据。但是，如果需要对 docker 容器代码或 .yaml 进行任何更改，请告诉我

KFP 代码

import os
from pathlib import Path
import requests

import kfp

#Load the component
component1 = kfp.components.load_component_from_file('comp_typed.yaml')
component2 = kfp.components.load_component_from_file('component2.yaml')
component3 = kfp.components.load_component_from_file('component3.yaml')
component4 = kfp.components.load_component_from_file('component4.yaml')

#Use the component as part of the pipeline
@kfp.dsl.pipeline(name='Document Processing Pipeline', description='Document Processing Pipeline')
def data_passing():
    task1 = component1()
    task2 = component2(task1.output)
    task3 = component3(task2.output)
    task4 = component4(task3.output)

comp_typed.yaml 代码

name: DPC
description: This is an example
implementation:
  container:
    image: gcr.io/pro1-in-us/dpc_comp1@sha256:3768383b9cd694936ef00464cb1bdc7f48bc4e9bbf08bde50ac7346f25be15de
    command: [python3, /dpc_comp1.py,]

component2.yaml

name: Custom_Plugin_1
description: This is an example
implementation:
  container:
    image: gcr.io/pro1-in-us/plugin1@sha256:16cb4aa9edf59bdf138177d41d46fcb493f84ce798781125dc7777ff5e1602e3
    command: [python3, /plugin1.py,]

我尝试了this 和this，但除了错误之外什么也做不了。我是 python 和 kubeflow 的新手。我应该进行哪些代码更改以使用 KFP SDK 在所有 4 个组件之间传递数据。数据可以是文件/字符串

假设，组件 1 从 gs 存储桶下载了一个 .pdf 文件，我可以将相同的文件提供给下一个下游组件吗？组件 1 将文件下载到组件 1 docker 容器的 '/tmp/doc_pages' 位置，我认为该容器是该特定容器的本地位置，并且下游组件无法读取它们？

Answer 1

This notebook，它描述了如何在 KFP 组件之间传递数据，可能会有用。它包含“小数据”的概念，直接传递；与您写入文件的“大数据”相比，然后（如示例笔记本中所示）输入和输出文件的路径由系统选择并传递给函数（作为字符串）。

如果您不需要在步骤之间传递数据，但想要指定步骤排序依赖项（例如，op2 直到 op1 完成后才会运行），您可以在管道定义中指出这一点，如下所示：

op2.after(op1)

Answer 2

除了艾米的出色回答：

您的管道是正确的。建立组件之间依赖关系的最好方法是建立数据依赖关系。

让我们看看你的管道代码：

task2 = component2(task1.output)

您将task1 的输出传递给component2。这应该会产生您想要的依赖关系。但是有几个问题（如果您尝试编译，您的管道会显示编译错误）：

1. component1 需要有输出
2. component2 需要输入
3. component2 需要有一个输出（以便您可以将其传递给 component3）

等等

让我们添加它们：

name: DPC
description: This is an example
outputs:
- name: output_1
implementation:
  container:
    image: gcr.io/pro1-in-us/dpc_comp1@sha256:3768383b9cd694936ef00464cb1bdc7f48bc4e9bbf08bde50ac7346f25be15de
    command: [python3, /dpc_comp1.py, --output-1-path, {outputPath: output_1}]

name: Custom_Plugin_1
description: This is an example
inputs:
- name: input_1
outputs:
- name: output_1
implementation:
  container:
    image: gcr.io/pro1-in-us/plugin1@sha256:16cb4aa9edf59bdf138177d41d46fcb493f84ce798781125dc7777ff5e1602e3
    command: [python3, /plugin1.py, --input-1-path, {inputPath: input_1}, --output-1-path, {outputPath: output_1}]

通过这些更改，您的管道应该编译并显示您想要的依赖项。

请查看tutorial关于从命令行程序创建组件。

Answer 3

如果你不想通过输出使用依赖或者在组件之间传递任何数据，你可以参考上一步中的 PVC 来显式调用依赖。

示例： 您可以创建 PVC 来存储数据。

vop = dsl.VolumeOp(name="pvc",
                   resource_name="pvc", size=<size>, 
                   modes=dsl.VOLUME_MODE_RWO,)

在组件中使用它：

download = dsl.ContainerOp(name="download",image="", 
                           command=[" "], arguments=[" "], 
                           pvolumes={"/data": vop.volume},)

现在您可以调用下载和训练之间的依赖关系，如下所示：

train = dsl.ContainerOp(name="train",image="", 
                        command=[" "], arguments=[" "], 
                        pvolumes={"/data": download.pvolumes["/data"]},)