平行坐标的实现？ [关闭]答案

【问题标题】：Implementation of parallel coordinates? [closed]平行坐标的实现？ [关闭]
【发布时间】：2010-10-15 13:10:04
【问题描述】：

我想为我的多维结果实现平行坐标。有没有人可以很好地链接到它在 matlab 或 R 中的实现？此外，关于生成平行坐标的最佳工具有什么建议吗？

【问题讨论】：

不知道为什么关闭，这对我来说似乎是合理的。 ggplot2 有一个辅助函数ggpcp()，它允许您使用任何具有标准几何图形的数据框来创建平行坐标图。
您现在可以使用 Plotly 制作交互式平行坐标。看看：plot.ly/r/parallel-coordinates-plot

【解决方案1】：

R 解决方案

lattice包是R自带的，包含parallel函数：

 parallel(~iris[1:4] | Species, iris)

ggplot2 也是你的朋友：

D <- data.frame(Gain = rnorm(20),  
                Trader = factor(LETTERS[1:4]), 
                Day = factor(rep(1:5, each = 4)))
ggplot(D) + 
  geom_line(aes(x = Trader, y = Gain, group = Day, color = Day))

lattice 和 ggplot 需要不同“形状”的输入数据。对于 lattice，它是一种矩阵形式，每一列都是一个表示在一个平行坐标上的变量。对于 ggplot 它是一列（增益）和变量的单独指标（上面的交易者）。 /这就是我使用两个不同示例的原因，而不是在这里混淆数据重塑/。

如果您需要一些快速的东西，那么 lattice 可能适合您。 ggplot 需要一些时间投入。

【讨论】：

对于 ggplot2 解决方案 - 在 GGally 包中还有 ggparcoord 函数。
我正在尝试使用 ggplot，它适用于 20 个项目。但是，如果我生成 40 个项目，那么每天得到 8 个点（例如，第 1 天的 A 中有一条垂直线，因为有 2 个点）。你能告诉我每四点分割线的方法吗？

【解决方案2】：

GGobi 已经拥有了很长时间（因为它的前身 XGobi 已经拥有它）。

您可以通过来自R 的rggobi 包访问它。作为开源，你也可以深入了解。

【讨论】：

【解决方案3】：

如果您希望使用平行坐标，MATLAB 在统计工具箱中有一个实现：PARALLELCOORDS。

否则，如果您想自己实现一个，基本版本（没有所有的花里胡哨）应该很容易做到：

load fisheriris            %# load some data
%#meas = zscore(meas);     %# to normalize the attributes
h = plot(meas');            %'# plot
set(gca, 'XTick',1:4, 'XTickLabel',{'SL' 'SW' 'PL' 'PW'}, 'XGrid','on')
ylabel('feature value'), title('Parallel Coordinates')

%# color according to class label
c = grp2idx(species);
clr = lines( numel(c) );
arrayfun(@(k) set(h(c==k),'Color',clr(k,:)), unique(c))

【讨论】：

@downvoter：想解释一下你的反对意见吗？ OP 要求提供 R 或 MATLAB 代码；上面的代码工作得很好..
抱歉，我投了反对票，因为我没有注意到这个问题也针对 MATLAB...

【解决方案4】：

MASS 包（适用于大多数 R 安装）包括平行坐标的实现。函数parcoord。

来自 Iris 数据集的 ?parcoord -a bit Correct-的示例：

ir <- rbind(iris3[,,1], iris3[,,2], iris3[,,3])
parcoord(log(ir)[, c(1, 2, 3, 4)], col = 1 + (0:149)%/%50)

【讨论】：